RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 XRCC2O43543 280 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 SERPINA3P01011 423 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 LCKP06239 509 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CECR9P0C854 216 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 PLA2G2AP14555 144 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF12P17014 697 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CCNOP22674 350 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 PTAFRP25105 342 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 GABRA5P31644 462 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF83P51522 516 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CCR9P51686 369 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 TFF3Q07654 80 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 GPR50Q13585 617 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC54Q8NEL0 328 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 OR2G2Q8NGZ5 317 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 PGAM5Q96HS1 289 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 C4orf45Q96LM5 186 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 DACH2Q96NX9 599 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 OPALINQ96PE5 141 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 OR5M11Q96RB7 305 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 NOX3Q9HBY0 568 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 FAM206AQ9NX38 181 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CHD6Q8TD26 2715 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1B0GVI7 797 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 PRR32B1ATL7 298 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 H3BSA7 217 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CASKO14936 926 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 GOSR1O95249 250 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 LCATP04180 440 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CD1AP06126 327 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ADRA2AP08913 450 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ACSM4P0C7M7 580 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CELP19835 753 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 TUBG1P23258 451 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 PCSK6P29122 969 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 PRKXP51817 358 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 YIF1BQ5BJH7 314 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM244Q5VVB8 128 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 FTMTQ8N4E7 242 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 MS4A15Q8N5U1 240 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF485Q8NCK3 441 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 OR5AK2Q8NH90 309 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ITFG2Q969R8 447 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 RADILQ96JH8 1075 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 PBOV1Q9GZY1 135 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 PLEKHA1Q9HB21 404 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0U1RQV5 110 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 PLPP2O43688 288 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 INMTO95050 263 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 HLA-DPB1P04440 258 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 CD2P06729 351 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 ACHEP22303 614 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 PSMB10P40306 273 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 RAD52P43351 418 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 KIR2DL3P43628 341 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 NAAAQ02083 359 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 SLC3A1Q07837 685 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 TPBGQ13641 420 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 BLMHQ13867 455 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 GFOD2Q3B7J2 385 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-211ENST00000497210 BEX5Q5H9J7 111 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms