RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	DECR2	Q9NUI1	292 aa		7.11	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	IL19	Q9UHD0	177 aa		7.11	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		7.11	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	7.11	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	ZAN	Q9Y493	2812 aa		7.11	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	SNTN	A6NMZ2	147 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	CD5L	O43866	347 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	LY6H	O94772	140 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	LCAT	P04180	440 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	HTR1F	P30939	366 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	MAGEB1	P43366	347 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	CX3CR1	P49238	355 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	CHN2	P52757	468 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	CCL8	P80075	99 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	EGR3	Q06889	387 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	HFE	Q30201	348 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	FTMT	Q8N4E7	242 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	ERGIC1	Q969X5	290 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	EME1	Q96AY2	570 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	C1orf159	Q96HA4	380 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	MRO	Q9BYG7	248 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	POFUT1	Q9H488	388 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	CENPM	Q9NSP4	180 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	CLN6	Q9NWW5	311 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	TMEM160	Q9NX00	188 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128		A0A0U1RQV5	110 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	CLDN25	C9JDP6	229 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	SLC16A6	O15403	523 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	GMDS	O60547	372 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	H2BFM	P0C1H6	154 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	SBK2	P0C263	348 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	CPT2	P23786	658 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	GZMK	P49863	264 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	RIPPLY3	P57055	190 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	ACTC1	P68032	377 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	ACTA1	P68133	377 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	OR8B8	Q15620	311 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128		Q6ZR03	302 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	USP51	Q70EK9	711 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	KRT74	Q7RTS7	529 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	SPERT	Q8NA61	448 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	YIPF5	Q969M3	257 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	TIMD4	Q96H15	378 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	OR8B4	Q96RC9	309 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	AMELY	Q99218	206 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	OR10A2	Q9H208	303 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	MSL2	Q9HCI7	577 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	ABCB9	Q9NP78	766 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	LRP12	Q9Y561	859 aa		7.09	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	ZFHX3	Q15911	3703 aa		7.09	□□□□□ -1.28
USP34-208	ENST00000467128	MTOR	P42345	2549 aa		7.08	□□□□□ -1.28
USP34-208	ENST00000467128	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		7.08	□□□□□ -1.28
USP34-208	ENST00000467128	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		7.08	□□□□□ -1.28
USP34-208	ENST00000467128	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		7.08	□□□□□ -1.28
USP34-208	ENST00000467128	CD300LB	A8K4G0	201 aa		7.08	□□□□□ -1.28
USP34-208	ENST00000467128	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		7.08	□□□□□ -1.28
USP34-208	ENST00000467128	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
USP34-208	ENST00000467128	TMPRSS2	O15393	492 aa		7.08	□□□□□ -1.28
USP34-208	ENST00000467128	MLNR	O43193	412 aa		7.08	□□□□□ -1.28
USP34-208	ENST00000467128	SPRY3	O43610	288 aa		7.08	□□□□□ -1.28

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