RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	FCN3	O75636	299 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	FSTL3	O95633	263 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	GRP	P07492	148 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	SFTPB	P07988	381 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	ENTPD1	P49961	510 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	DRAM2	Q6UX65	266 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	NDE1	Q9NXR1	346 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	RNF7	Q9UBF6	113 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	DHRS12	A0PJE2	317 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM183A	A6NL82	134 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	PHYH	O14832	338 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	TMPRSS2	O15393	492 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	FMO3	P31513	532 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	FOXL1	Q12952	345 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	TAF13	Q15543	124 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	OR8B8	Q15620	311 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	PCK2	Q16822	640 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	ERGIC1	Q969X5	290 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC25A28	Q96A46	364 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	KCNJ15	Q99712	375 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF747	Q9BV97	191 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-208	ENST00000392449	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449		A6NLC8	198 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	LGALS8	O00214	317 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	TBX1	O43435	398 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ADAM20	O43506	726 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	GMDS	O60547	372 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	GYPA	P02724	150 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	OMG	P23515	440 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	CPT2	P23786	658 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	MICA	Q29983	383 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	SPATS1	Q496A3	300 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	WDR86	Q86TI4	376 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	DHFR2	Q86XF0	187 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	FGFRL1	Q8N441	504 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	LINC00471	Q8N535	108 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	OR2T33	Q8NG76	320 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	OR2T29	Q8NH02	315 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	AMELY	Q99218	206 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	REEP1	Q9H902	201 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449		A0A1B0GW55	424 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF878	C9JN71	531 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	WIPF1	O43516	503 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	MTNR1A	P48039	350 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	CX3CR1	P49238	355 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC25A1	P53007	311 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	OTULIN	Q96BN8	352 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC22A4	Q9H015	551 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	DUX4	Q9UBX2	424 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	OOEP	A6NGQ2	149 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	CLDN34	H7C241	214 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	CFHR2	P36980	270 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21

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