RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 AKR1C2P52895 323 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 AKR1C1Q04828 323 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 SSPNQ14714 243 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF684Q5T5D7 378 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 SKA3Q8IX90 412 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 PAQR8Q8TEZ7 354 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 OIT3Q8WWZ8 545 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 ASB10Q8WXI3 467 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 INPP5EQ9NRR6 644 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 DKKL1Q9UK85 242 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 DMRT1Q9Y5R6 373 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC187A0A096LP49 1063 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 LIFP15018 202 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 HYAL4Q2M3T9 481 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 SLC35D3Q5M8T2 416 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 PRSS35Q8N3Z0 413 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 ASH2LQ9UBL3 628 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 BSNQ9UPA5 3926 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 OR2A4O95047 310 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 IZUMO1Q8IYV9 350 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 WNT2BQ93097 391 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM68Q96MH6 324 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 OR2A7Q96R45 310 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 PIGMQ9H3S5 423 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 CENPMQ9NSP4 180 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 PITPNAQ00169 270 aa15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 UQCC3Q6UW78 93 aa15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 RASL12Q9NYN1 266 aa15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 ABHD16AO95870 558 aa15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 CPN1P15169 458 aa15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 MTNR1BP49286 362 aa15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 MMP15P51511 669 aa15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 ACTA2P62736 377 aa15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 ACTG2P63267 376 aa15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 OTOSQ8NHW6 89 aa15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 ANGPTL4Q9BY76 406 aa15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 KMT2EQ8IZD2 1858 aa15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 C1orf196B1AJZ1 125 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 OGG1O15527 345 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 BLOC1S1P78537 153 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 DYRK1AQ13627 763 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 SSX2Q16385 188 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 OR6K3Q8NGY3 331 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 GINS4Q9BRT9 223 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 ABHD6Q9BV23 337 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 A0A0G2JK05 382 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 A0A0J9YW62 118 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 SC5DO75845 299 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 UBL3O95164 117 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 FTH1P19P0C7X4 201 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 GMFBP60983 142 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 FABP9Q0Z7S8 132 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 EMC4Q5J8M3 183 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 TEX30Q5JUR7 227 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 H3F3CQ6NXT2 135 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 DCXRQ7Z4W1 244 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 SLC43A2Q8N370 569 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 OR14L1PQ8NHC6 308 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 LHX6Q9UPM6 363 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa15.85■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 A0A1B0GWJ7 208 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 LMX1BO60663 402 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 CLN5O75503 358 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 ATF1P18846 271 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 GABREP78334 506 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 SRYQ05066 204 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 SFXN4Q6P4A7 337 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 FBXO17Q96EF6 278 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 KCNK17Q96T54 332 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 GFI1Q99684 422 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 DDA1Q9BW61 102 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 SRXN1Q9BYN0 137 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 MFFQ9GZY8 342 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 KCNK15Q9H427 330 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 SH2D2AQ9NP31 389 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 LRFN1Q9P244 771 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 CSAG2Q9Y5P2 127 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-204ENST00000358923 FAM166BA8MTA8 275 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms