RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.94□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 CLPTM1O96005 669 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 WNT11O96014 354 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ITGA5P08648 1049 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 CD79AP11912 226 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 HSD11B1P28845 292 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ARR3P36575 388 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 RPS27P42677 84 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 HCCSP53701 268 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 PLP2Q04941 152 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 EGR3Q06889 387 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 MED22Q15528 200 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SFRP5Q5T4F7 317 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 RNLSQ5VYX0 342 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 OTPQ5XKR4 325 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF544Q6NX49 715 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SYT9Q86SS6 491 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SPARTQ8N0X7 666 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 C17orf78Q8N4C9 275 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 YIPF7Q8N8F6 280 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 OR52N5Q8NH56 324 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 RORBQ92753 470 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 NABP1Q96AH0 204 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SH3GL3Q99963 347 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 TTTY10Q9BZA0 68 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 CENPMQ9NSP4 180 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 PLEK2Q9NYT0 353 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 PRR14LQ5THK1 2151 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM129A0AVI4 362 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF878C9JN71 531 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 H7C417 338 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 J3QLW9 94 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 J3QRE1 110 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 MT-ND5P03915 603 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 H2BFMP0C1H6 154 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 HSMCR30P0CW71 290 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF19P17023 458 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ALOX5APP20292 161 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 COX5AP20674 150 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 PAX7P23759 505 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ETV1P50549 477 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 RIDAP52758 137 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 WNT4P56705 351 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 PCK2Q16822 640 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 TBRG1Q3YBR2 411 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 CORO6Q6QEF8 472 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 KCTD8Q6ZWB6 473 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF627Q7L945 461 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SKA3Q8IX90 412 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 STEAP2Q8NFT2 490 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 OR52N1Q8NH53 320 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SGCDQ92629 289 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SLAMF6Q96DU3 332 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ABHD6Q9BV23 337 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 OBP2BQ9NPH6 170 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 GNG8Q9UK08 70 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 COPS3Q9UNS2 423 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 AMDHD2Q9Y303 409 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 METTL15A6NJ78 407 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 G3V4G9 280 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 RER1O15258 196 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SGCEO43556 437 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 DOK2O60496 412 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF254O75437 659 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SULT1C4O75897 302 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 PTHP01270 115 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 APOC1P02654 83 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SCG5P05408 212 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF32P17041 273 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 MAP2K4P45985 399 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 TAS2R43P59537 309 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 GRB2P62993 217 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF85Q03923 595 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.9 ms