RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 MOGQ16653 247 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SLC35F2Q8IXU6 374 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ZNF679Q8IYX0 411 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 OR51G2Q8NGK0 314 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 OR1J1Q8NGS3 322 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ABHD4Q8TB40 342 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 THEM6Q8WUY1 208 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SLC7A6Q92536 515 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ZNF799Q96GE5 643 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 OR8B4Q96RC9 309 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 COPS4Q9BT78 406 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 MROQ9BYG7 248 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 HIVEP2P31629 2446 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 TMEM129A0AVI4 362 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ACOD1A6NK06 481 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 F5H5K5 113 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 H7C417 338 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 GPRIN2O60269 458 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SULT1C4O75897 302 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 CLIC3O95833 236 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 IGHV3-13P01766 116 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 LCKP06239 509 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 H2BFMP0C1H6 154 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 FAM157BP0CG42 384 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 HSD11B1P28845 292 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ATP6V1E1P36543 226 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 LIPAP38571 399 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 PPOXP50336 477 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SELENOVP59797 346 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 CXCR4P61073 352 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 PPP1CBP62140 327 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ZNF91Q05481 1191 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 TAF13Q15543 124 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 MST1LQ2TV78 715 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 KLHL22Q53GT1 634 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 FBXW12Q6X9E4 464 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SPERTQ8NA61 448 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SYNPRQ8TBG9 265 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 RNFT2Q96EX2 444 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 AMELYQ99218 206 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 DOK1Q99704 481 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 JAM3Q9BX67 310 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 OPA3Q9H6K4 179 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 CENPMQ9NSP4 180 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 GPR160Q9UJ42 338 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 RAB26Q9ULW5 256 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 LRP12Q9Y561 859 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 TANC2Q9HCD6 1990 aa8.46□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 XRCC2O43543 280 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 FADS2O95864 444 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 NGFP01138 241 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 IGHA1P01876 353 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 GNAO1P09471 354 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 PIPP12273 146 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 RAC2P15153 192 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 KITLGP21583 273 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 MYF6P23409 242 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 GCH1P30793 250 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 CX3CR1P49238 355 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 MMP16P51512 607 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 EFNA4P52798 201 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 DSCR9P59020 149 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 CSNK2BP67870 215 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 CDK5R2Q13319 367 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 MED21Q13503 144 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 MSMPQ1L6U9 139 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 VHLLQ6RSH7 139 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
GGA3-209ENST00000580646 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.46□□□□□ -1.06
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