RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAV24A0A0B4J272 114 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRSS37A4D1T9 235 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR2AT4A6NND4 320 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 M0R036 132 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AP4M1O00189 453 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLPP2O43688 288 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIAP1O43715 76 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYNGR3O43761 229 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCDH7O60245 1069 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIAA0513O60268 411 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1orf105O95561 183 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACTL6AO96019 429 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFNA5P01569 189 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EPOP01588 193 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV2-70P01814 119 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PET100P0DJ07 73 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSPAN8P19075 237 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFNA8P32881 189 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLA2G16P53816 162 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSME3P61289 254 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXE3Q13461 319 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR4D1Q15615 310 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NDUFA9Q16795 377 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BSXQ3C1V8 233 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UTF1Q5T230 341 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM268Q5VZI3 342 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRRN1Q6UXK5 716 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDIK1LQ8N165 341 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RFLNBQ8N5W9 214 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPFIBP2Q8ND30 876 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 B3GNT7Q8NFL0 401 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR1L6Q8NGR2 347 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR52I2Q8NH67 350 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR2V1Q8NHB1 315 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HMGCLL1Q8TB92 370 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCP10LQ8TDR4 215 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEK7Q8TDX7 302 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C22orf15Q8WYQ4 148 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEUROG1Q92886 237 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NTNG2Q96CW9 530 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF170Q96K19 258 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRAP1Q96NZ9 151 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPR78Q96P69 363 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC38A2Q96QD8 506 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TEAD3Q99594 435 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RSG1Q9BU20 258 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SFXN3Q9BWM7 321 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF696Q9H7X3 374 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C10orf88Q9H8K7 445 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MARCH7Q9H992 704 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLGRKTQ9HBL7 147 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PROK2Q9HC23 129 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HRASLSQ9HDD0 168 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BABAM2Q9NXR7 383 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAC3Q9UHF0 121 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SH2B3Q9UQQ2 575 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMED7Q9Y3B3 224 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A3GALT2U3KPV4 340 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRRC30A6NM36 301 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CENPXA8MT69 81 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM157AC9JC47 383 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLDN34H7C241 214 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 M0QXV9 152 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AIREO43918 545 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNFSF13O75888 250 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSMG1O95456 288 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPR2P20594 1047 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COMTP21964 271 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RFX3P48380 749 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SOX2P48431 317 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DYNLT1P63172 113 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STX4Q12846 297 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BNIP2Q12982 314 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYP1B1Q16678 543 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPR33Q49SQ1 333 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GGTA1PQ4G0N0 100 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCE4AQ5TA78 99 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STUMQ69YW2 141 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYB5R2Q6BCY4 276 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMPRSS11BQ86T26 416 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPSM1Q86YR5 675 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CROCCP3Q8IVE0 287 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms