RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 IMPA2O14732 288 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 ARPC3O15145 178 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 TXNDC12O95881 172 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 PSG7Q13046 419 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 IL18R1Q13478 541 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZR03 302 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 FAM81AQ8TBF8 368 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 ZFAND2BQ8WV99 257 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 SLC7A6Q92536 515 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 UBE2FQ969M7 185 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 Q96M85 177 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 Q9H521 79 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 C7orf69Q9H7B7 122 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 POLE4Q9NR33 117 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 TMEM89A2RUT3 159 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 SURF4O15260 269 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 IDH3BO43837 385 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 PRKYO43930 277 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 HMGN1P05114 100 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 ADH4P08319 380 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 SBK2P0C263 348 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 MSR1P21757 451 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 RPS6KA3P51812 740 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 CDC42P60953 191 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 ISL1P61371 349 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 EFNB1P98172 346 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 MESTQ5EB52 335 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 GPR139Q6DWJ6 353 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 USP43Q70EL4 1123 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 THAP5Q7Z6K1 395 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 ENTHD1Q8IYW4 607 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 ZDHHC22Q8N966 263 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 RHOXF1Q8NHV9 184 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 FAM216AQ8WUB2 273 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 FBLIM1Q8WUP2 373 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 RASD2Q96D21 266 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 CNBD2Q96M20 576 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 APOL4Q9BPW4 351 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 EGLN1Q9GZT9 426 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 ELOVL3Q9HB03 270 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 MMP26Q9NRE1 261 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 IMPAD1Q9NX62 359 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 TVP23BQ9NYZ1 205 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 AASSQ9UDR5 926 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 STARD10Q9Y365 291 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 A6NIZ1 184 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 C12orf71A8MTZ7 269 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 TRIM77I1YAP6 450 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 J3QLI3 93 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 DOK2O60496 412 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 ICMTO60725 284 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 ABHD16AO95870 558 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 FSHBP01225 129 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 IGHV2-70P01814 119 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 CD55P08174 381 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 NR2C1P13056 603 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 GABRB1P18505 474 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 SDHAP31040 664 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 HTR5AP47898 357 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 COMPP49747 757 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 RAP1BP61224 184 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 PCBD1P61457 104 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 RAP1AP62834 184 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 SCGB2A2Q13296 93 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 CDK5R2Q13319 367 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 SNAPC1Q16533 368 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 LAIR2Q6ISS4 152 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 PTCHD4Q6ZW05 846 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 TCEANCQ8N8B7 351 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 SETD9Q8NE22 299 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 OR2Z1Q8NG97 314 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 OR4K13Q8NH42 304 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 NANPQ8TBE9 248 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 IL4I1Q96RQ9 567 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 DDOQ99489 341 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 PRRG3Q9BZD7 231 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 CMC2Q9NRP2 79 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 CYSLTR2Q9NS75 346 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PRAME-212ENST00000485532 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms