RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 SPTSSAQ969W0 71 aa14.91□□□□□ -0.02
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HDDC3-201ENST00000330334 SLC22A4Q9H015 551 aa14.91□□□□□ -0.02
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HDDC3-201ENST00000330334 H0YL77 283 aa14.9□□□□□ -0.02
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HDDC3-201ENST00000330334 MIOXQ9UGB7 285 aa14.89□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.89□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 F5H5P2 479 aa14.88□□□□□ -0.03
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HDDC3-201ENST00000330334 T-ENOLP0DO92 83 aa14.88□□□□□ -0.03
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HDDC3-201ENST00000330334 MAB21L1Q13394 359 aa14.88□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.88□□□□□ -0.03
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HDDC3-201ENST00000330334 ASB9Q96DX5 294 aa14.88□□□□□ -0.03
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HDDC3-201ENST00000330334 RAP2AP10114 183 aa14.87□□□□□ -0.03
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HDDC3-201ENST00000330334 PAX8Q06710 450 aa14.87□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF404Q494X3 552 aa14.87□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 MOGAT3Q86VF5 341 aa14.87□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.87□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.87□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 VNN3Q9NY84 501 aa14.87□□□□□ -0.03
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HDDC3-201ENST00000330334 TMEM89A2RUT3 159 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 ARRDC5A6NEK1 342 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 TVP23AA6NH52 213 aa14.86□□□□□ -0.03
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