RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477234.1

SBF1-208, Transcript of SET binding factor 1, human

TSL 5

Gene SBF1, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF1-208	ENST00000477234	TUBA1B	P68363	451 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	TUBA4A	P68366	448 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	MVK	Q03426	396 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	FHL1	Q13642	323 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	GSG1	Q2KHT4	349 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	NIPAL3	Q6P499	406 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	TUBA1A	Q71U36	451 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	TMEM99	Q8N816	258 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	FNDC8	Q8TC99	324 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	CNBD2	Q96M20	576 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	GAL3ST1	Q99999	423 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	CMC2	Q9NRP2	79 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	CLN6	Q9NWW5	311 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	C17orf100	A8MU93	164 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	CENPBD1	B2RD01	187 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	MS4A18	H0YCH9	400 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	PPP1R3D	O95685	299 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	REN	P00797	406 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	F13B	P05160	661 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	CELA3B	P08861	270 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	EPHA2	P29317	976 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	SELENOP	P49908	381 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	TAF9	Q16594	264 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	MDP1	Q86V88	176 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	TMEM163	Q8TC26	289 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	RFK	Q969G6	155 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF69	Q9UC07	566 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	SURF4	O15260	269 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	NDUFA7	O95182	113 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	RAB36	O95755	333 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	NGF	P01138	241 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	GNAO1	P09471	354 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF35	P13682	527 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	CENPA	P49450	140 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	P2RY4	P51582	365 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	RAG2	P55895	527 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	BPIFB3	P59826	476 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	CXCR4	P61073	352 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	ISL1	P61371	349 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	ERVK-25	P63136	954 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	FAM122B	Q7Z309	247 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	GID4	Q8IVV7	300 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	NELFA	Q9H3P2	528 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF726	A6NNF4	738 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	CDC14B	O60729	498 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	SERPINI2	O75830	405 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	NCR1	O76036	304 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	CLIC3	O95833	236 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	IGHG1	P01857	330 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SBF1-208	ENST00000477234	NAT2	P11245	290 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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