RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-208	ENST00000392449	ADCK1	Q86TW2	530 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	NANP	Q8TBE9	248 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	SAMD8	Q96LT4	415 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	NMNAT3	Q96T66	252 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	NDUFAB1	O14561	156 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	TXNDC12	O95881	172 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	SELE	P16581	610 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	TNFSF4	P23510	183 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	MMP16	P51512	607 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	RPS6KA3	P51812	740 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	BTG1	P62324	171 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	KCNMB1	Q16558	191 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	LEG1	Q6P5S2	330 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	OR6V1	Q8N148	313 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	OR4K13	Q8NH42	304 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	OR52D1	Q9H346	318 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	GCM1	Q9NP62	436 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	GADD45G	O95257	159 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	RAC2	P15153	192 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	TNFRSF1A	P19438	455 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	USP43	Q70EL4	1123 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PTP4A1	Q93096	173 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	IL19	Q9UHD0	177 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	B9D1	Q9UPM9	204 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	MLNR	O43193	412 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	FOXH1	O75593	365 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	GATA3	P23771	443 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC6A9	P48067	706 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	HIST1H3A	P68431	136 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	RFX4	Q33E94	735 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	SPIC	Q8N5J4	248 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PYURF	Q96I23	114 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	DUX5	Q96PT3	197 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	IFT27	Q9BW83	186 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449		F5H5P2	479 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	TMEM178B	H3BS89	294 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	TRIM77	I1YAP6	450 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ARPC2	O15144	300 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	OR10H3	O60404	316 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	GMNN	O75496	209 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	HLA-DPB1	P04440	258 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	TUBG1	P23258	451 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ANOS1	P23352	680 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PRDX6	P30041	224 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM201A	Q5SY85	155 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	NAA40	Q86UY6	237 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	TEX29	Q8N6K0	151 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	GJC3	Q8NFK1	279 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	OR8G5	Q8NG78	346 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	OR6C68	A6NDL8	312 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	SNX3	O60493	162 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	CRABP1	P29762	137 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	RRM2	P31350	389 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC6A6	P31641	620 aa		13.92	□□□□□ -0.18

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