RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	REN	P00797	406 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	IGHV3-13	P01766	116 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	TF	P02787	698 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	COX5B	P10606	129 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF23	P17027	643 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	SELENOV	P59797	346 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	CCL8	P80075	99 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	KCNMB1	Q16558	191 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	LINC00471	Q8N535	108 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	SNX33	Q8WV41	574 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	SNX18	Q96RF0	628 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	WAC	Q9BTA9	647 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	CHID1	Q9BWS9	393 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	IL20	Q9NYY1	176 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	IDH3B	O43837	385 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	LILRA1	O75019	489 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	RP2	O75695	350 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	PSKH1	P11801	424 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	GCH1	P30793	250 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	PYCR1	P32322	319 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	MMP15	P51511	669 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	FLOT2	Q14254	428 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	RDH5	Q92781	318 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	DDO	Q99489	341 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	GPR160	Q9UJ42	338 aa		11	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	AQP12B	A6NM10	295 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	WNT9B	O14905	357 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	SPRY3	O43610	288 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	CDC14B	O60729	498 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	CST1	P01037	141 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	IGHV1-46	P01743	117 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	TACSTD2	P09758	323 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF81	P51508	661 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	ARHGDIA	P52565	204 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	HIST1H3A	P68431	136 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	TEK	Q02763	1124 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	COX10	Q12887	443 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	CCNI	Q14094	377 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	SPATA24	Q86W54	205 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	FEV	Q99581	238 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	CHODL	Q9H9P2	273 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	MSL2	Q9HCI7	577 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPSA-208	ENST00000487876	POMP	Q9Y244	141 aa		10.99	□□□□□ -0.65

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