RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC7A6	Q92536	515 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC38A4	Q969I6	547 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	AJUBA	Q96IF1	538 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF702P	Q9H963	129 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	TBK1	Q9UHD2	729 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	HDAC3	O15379	428 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2T1	O43869	369 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	TPST1	O60507	370 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	HLA-DPB1	P04440	258 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	BCHE	P06276	602 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CPA3	P15088	417 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	EPHA3	P29320	983 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ECHS1	P30084	290 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CRHR1	P34998	444 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	HTR5A	P47898	357 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NME5	P56597	212 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP10-2	P60368	255 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	GNG11	P61952	73 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MPPED2	Q15777	294 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SGCA	Q16586	387 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	GTDC1	Q4AE62	458 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	LIN52	Q52LA3	116 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2T2	Q6IF00	324 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PXK	Q7Z7A4	578 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR6X1	Q8NH79	312 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	C4orf45	Q96LM5	186 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4F4	Q96R69	305 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1orf198	Q9H425	327 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSPN	O60542	156 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTH	P01270	115 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	FGF4	P08620	206 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	FBP1	P09467	338 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	KITLG	P21583	273 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL12A	P29459	219 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	LIPA	P38571	399 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CRAT	P43155	626 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MPP2	Q14168	576 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	GNA13	Q14344	377 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	TAF11	Q15544	211 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST3H3	Q16695	136 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNF220	Q5VTB9	566 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NATD1	Q8N6N6	113 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q8N7P7	452 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NSMAF	Q92636	917 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF566	Q969W8	418 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM19	Q96HH6	336 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MKS1	Q9NXB0	559 aa		7	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MEIOC	A2RUB1	952 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC154	A6NI56	674 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOTO	A8MTQ0	251 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651		H3BQF6	201 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NPFF	O15130	113 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADAM20	O43506	726 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM20B	O75063	409 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHEK2	O96017	543 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	TFF1	P04155	84 aa		6.99	□□□□□ -1.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.2 ms