RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 RHOXF2Q9BQY4 288 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 UCK2Q9BZX2 261 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 OR52A5Q9H2C5 316 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 FAM96AQ9H5X1 160 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 SP140LQ9H930 580 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 WDR41Q9HAD4 459 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 ESM1Q9NQ30 184 aa4.54□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 G3V4G9 280 aa4.52□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa4.52□□□□□ -1.69
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CCL20-201ENST00000358813 TYROBPO43914 113 aa4.52□□□□□ -1.69
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CCL20-201ENST00000358813 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
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CCL20-201ENST00000358813 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
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