RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-215	ENST00000582821	WNT5A	P41221	380 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	HIST1H3A	P68431	136 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	AQP6	Q13520	282 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	MOG	Q16653	247 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	LNX2	Q8N448	690 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	TSSK2	Q96PF2	358 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	SYT3	Q9BQG1	590 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	YY1AP1	Q9H869	796 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	DUSP13	Q9UII6	198 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	GPR160	Q9UJ42	338 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	SGCE	O43556	437 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	CLPTM1	O96005	669 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	IGHV3-13	P01766	116 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	GAA	P10253	952 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	CCNO	P22674	350 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	GIF	P27352	417 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	ERVS71-1	P61550	626 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	GLO1	Q04760	184 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	ARL9	Q6T311	187 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	SPATA24	Q86W54	205 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF786	Q8N393	782 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	GIPC3	Q8TF64	312 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	C4orf45	Q96LM5	186 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	RERGL	Q9H628	205 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	FZR1	Q9UM11	496 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	11.97	□□□□□ -0.49	5e-8	■■■■□ 20.7
GGA3-215	ENST00000582821	OR6C6	A6NF89	314 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821		H3BSA7	217 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	DAO	P14920	347 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	ALDH3B1	P43353	468 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	SLC36A3	Q495N2	470 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	GJC3	Q8NFK1	279 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	FEV	Q99581	238 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	OR51B6	Q9H340	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-215	ENST00000582821	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		11.96	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821	JMJD1C	Q15652	2540 aa		11.96	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821		A0A1W2PPW3	197 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821	GNGT2	O14610	69 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821	DOK2	O60496	412 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821	FKBP6	O75344	327 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821	NGF	P01138	241 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821	TF	P02787	698 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821	NR4A2	P43354	598 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821	ARHGDIA	P52565	204 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821	PPP1CB	P62140	327 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821	TEK	Q02763	1124 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-215	ENST00000582821	OR2T33	Q8NG76	320 aa		11.95	□□□□□ -0.5

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