RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 LIMS3P0CW19 117 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 LIMS4P0CW20 117 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 HSMCR30P0CW71 290 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 LAMP1P11279 417 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 PRKACAP17612 351 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 CEBPBP17676 345 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 ETV5P41161 510 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 FRKP42685 505 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 RGRP47804 291 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 ARFIP1P53367 373 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 CDH4P55283 916 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 SMIM11AP58511 58 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 RPS25P62851 125 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 FABP5Q01469 135 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 DMC1Q14565 340 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 EXT1Q16394 746 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 LIPKQ5VXJ0 399 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 HBMQ6B0K9 141 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 RAET1GQ6H3X3 334 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 C22orf42Q6IC83 251 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 FAM166AQ6J272 317 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 C1orf94Q6P1W5 598 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 TMEM91Q6ZNR0 172 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 ZNF621Q6ZSS3 439 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 LUZP2Q86TE4 346 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 TPRA1Q86W33 373 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD46Q86W74 232 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 SERPINA9Q86WD7 417 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 EID2Q8N6I1 236 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 TMEM178AQ8NBL3 297 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 AQP11Q8NBQ7 271 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 OR5AP2Q8NGF4 316 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 OR8D4Q8NGM9 314 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 OR56B4Q8NH76 319 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 PIH1D2Q8WWB5 315 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 YIPF5Q969M3 257 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 WBP2Q969T9 261 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 RFT1Q96AA3 541 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 NXPE2Q96DL1 559 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 MSANTD3Q96H12 275 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 TSSK3Q96PN8 268 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 UQCC2Q9BRT2 126 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 MED28Q9H204 178 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 SDHAF2Q9NX18 166 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 PIPOXQ9P0Z9 390 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 VPS29Q9UBQ0 182 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 PPIL1Q9Y3C6 166 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 DOCK6Q96HP0 2047 aa4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 FRMPD3Q5JV73 1810 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GUH1 482 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 ZNF98A6NK75 572 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 C17orf105B2RV13 164 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 F8VVB4 439 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 F8VWA3 439 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 WWP2O00308 870 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 GABRPO00591 440 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 FLRT2O43155 660 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 HPGDSO60760 199 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 CLDN11O75508 207 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 KRT33AO76009 404 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 UBL3O95164 117 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 PAHP00439 452 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 IFNW1P05000 195 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 CXCL3P19876 107 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 GSTM3P21266 225 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 OPRD1P41143 372 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 TGM4P49221 684 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 XKP51811 444 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 ACLYP53396 1101 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 LIM2P55344 173 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 PFN3P60673 137 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 CDK6Q00534 326 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 SP3Q02447 781 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 VGLL4Q14135 290 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 OPCMLQ14982 345 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 HEPACAMQ14CZ8 416 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 TRAM1Q15629 374 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 MICBQ29980 383 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 MPPE1Q53F39 396 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 CLVS2Q5SYC1 327 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-204ENST00000542443 CPTPQ5TA50 214 aa4.31□□□□□ -1.72
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