RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 REM1O75628 298 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLPXO76031 633 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLIC3O95833 236 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD3GP09693 182 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEACAM3P40198 252 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RND2P52198 227 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLP1P60201 277 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFT88Q13099 833 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHIT1Q13231 466 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RCAN2Q14206 197 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAF9Q16594 264 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTSL3PQ5NE16 218 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFP41Q8N8Y5 198 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR9A2Q8NGT5 310 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LHX5Q9H2C1 402 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IKZF2Q9UKS7 526 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HYOU1Q9Y4L1 999 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNE3Q9Y6H6 103 aa1.96□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DENND4AQ7Z401 1863 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBXN8O00124 270 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CBR3O75828 277 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SERPIND1P05546 499 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL1RNP18510 177 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WARSP23381 471 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 F2RP25116 425 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPMTP51580 245 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL15RAQ13261 267 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TGFBIQ15582 683 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q6ZSR3 168 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIX1Q8N485 282 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM105Q8N8V8 129 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBL1YQ9BQ87 522 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf198Q9H425 327 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C8orf17Q9NRJ1 99 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF586Q9NXT0 402 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VANGL2Q9ULK5 521 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa1.95□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM47DPA6NHR8 397 aa1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C16orf90A8MZG2 172 aa1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDC7O00311 574 aa1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HLA-DQB1P01920 261 aa1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTSLP07711 333 aa1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF688P0C7X2 276 aa1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF43P17038 809 aa1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MX1P20591 662 aa1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRADDP78560 199 aa1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXL13Q8NEE6 735 aa1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CBY1Q9Y3M2 126 aa1.94□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SDK2Q58EX2 2172 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR89AB7ZAQ6 455 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR89BP0CG08 455 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB3AP20336 220 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCKP27707 260 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HNMTP50135 292 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARFIP1P53367 373 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAS2R31P59538 309 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BST2Q10589 180 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MPV17L2Q567V2 206 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NIPA1Q7RTP0 329 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR10AD1Q8NGE0 317 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR1P1Q8NH06 330 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SHC3Q92529 594 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TUBGCP3Q96CW5 907 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ENOPH1Q9UHY7 261 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KANK1Q14678 1352 aa1.93□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAV6A0A075B6T7 132 aa1.92□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa1.92□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR6C74A6NCV1 312 aa1.92□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 L7N2F9 121 aa1.92□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGLV3-25P01717 112 aa1.92□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ME2P23368 584 aa1.92□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LOXP28300 417 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CASP14P31944 242 aa1.92□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HCAR3P49019 387 aa1.92□□□□□ -2.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNX20Q7Z614 316 aa1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms