RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 RAD21L1Q9H4I0 556 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM38AQ9H6F2 299 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 RNF121Q9H920 327 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 ARL8BQ9NVJ2 186 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 ARMCX1Q9P291 453 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 GMEB1Q9Y692 573 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 TANC2Q9HCD6 1990 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 RNF13O43567 381 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 CHP2O43745 196 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 TRMUO75648 421 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 CIB2O75838 187 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 ATP6V1G2O95670 118 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV2-70P01814 119 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 ASAH2BP0C7U1 165 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 GPX2P18283 190 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 CD247P20963 164 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF81P51508 661 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 FOXL1Q12952 345 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SELPLGQ14242 412 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 MMEL1Q495T6 779 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 THEM4Q5T1C6 240 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM53Q6P2H8 277 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF613Q6PF04 617 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 DLEU7Q6UYE1 221 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 DOK3Q7L591 496 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 KRT73Q86Y46 540 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 ARMC8Q8IUR7 673 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SYT14Q8NB59 555 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A40Q8TBP6 338 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SNX33Q8WV41 574 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 CCL17Q92583 94 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 RAB1CQ92928 201 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 NABP1Q96AH0 204 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SPDL1Q96EA4 605 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 POM121L2Q96KW2 1035 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 GAL3ST1Q99999 423 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 PRSS27Q9BQR3 290 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF426Q9BUY5 554 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 C1orf21Q9H246 121 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 DECR2Q9NUI1 292 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 NDE1Q9NXR1 346 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SELENONQ9NZV5 590 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL21Q9UJP4 597 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 PRORSD1PA6NEY8 169 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 M0QX08 132 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 FMO6PO60774 539 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 OR6A2O95222 327 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 FARS2O95363 451 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SLC2A10O95528 541 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 NGFP01138 241 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF32P17041 273 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 CCNOP22674 350 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SLC6A2P23975 617 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 PRTN3P24158 256 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 CRYBA2P53672 197 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 UGT2B15P54855 530 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SELENOVP59797 346 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 STX1BP61266 288 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 FMODQ06828 376 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 MAPRE2Q15555 327 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 HFEQ30201 348 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SLC36A2Q495M3 483 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 RUNDC3AQ59EK9 446 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 FAM209AQ5JX71 171 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 TEX29Q8N6K0 151 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 HIPK4Q8NE63 616 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 NOXO1Q8NFA2 376 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 AKR7LQ8NHP1 331 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 MOSPD2Q8NHP6 518 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 PFN4Q8NHR9 129 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
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