RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 HIST3H3Q16695 136 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 NRN1LQ496H8 165 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 KCTD21Q4G0X4 260 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM177Q53S58 311 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 AADACL4Q5VUY2 407 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 RTL6Q6ICC9 239 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 TFAP2EQ6VUC0 442 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 ABHD4Q8TB40 342 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 APH1BQ8WW43 257 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 MCHR2Q969V1 340 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 LRRC46Q96FV0 321 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 MNTQ99583 582 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 KCNJ15Q99712 375 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 NUAK2Q9H093 628 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 COQ3Q9NZJ6 369 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 MEMO1Q9Y316 297 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 KALRNO60229 2985 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 DOCK7Q96N67 2140 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 SHANK1Q9Y566 2161 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 CCL21O00585 134 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 PHYHO14832 338 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 DHHO43323 396 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 TMCC2O75069 709 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 TNFSF13O75888 250 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 RAB36O95755 333 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 HRGP04196 525 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 GYPBP06028 91 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF823P16415 610 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 MSR1P21757 451 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 MPGP29372 298 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 MECP2P51608 486 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 NUDT6P53370 316 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 ADAM8P78325 824 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 PMPCAQ10713 525 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 KLHL22Q53GT1 634 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZT83 130 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 DPPA2Q7Z7J5 298 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 OR6V1Q8N148 313 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 STX19Q8N4C7 294 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF540Q8NDQ6 660 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 BBS1Q8NFJ9 593 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 NSMAFQ92636 917 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 MYDGFQ969H8 173 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 RNFT2Q96EX2 444 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 INTS14Q96SY0 518 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 KCNN2Q9H2S1 579 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 NELFAQ9H3P2 528 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 MED20Q9H944 212 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 CRLF2Q9HC73 371 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 HAO2Q9NYQ3 351 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 B9D1Q9UPM9 204 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC182A6NF36 153 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 UPK3AO75631 287 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 CLUP10909 449 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 BMP5P22003 454 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 CRHBPP24387 322 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 LAP3P28838 519 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 CHRNB4P30926 498 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 PYCR1P32322 319 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 HSF2Q03933 536 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 P2RY6Q15077 328 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.54□□□□□ -1.04
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