RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 TAGLN3Q9UI15 199 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 WNK2Q9Y3S1 2297 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 A0A0G2JMP0 313 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 A0A0X1KG70 313 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 C5orf58C9J3I9 102 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 J3QLI3 93 aa5.53□□□□□ -1.52
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HOXD8-202ENST00000429017 MFN2O95140 757 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 CH25HO95992 272 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV1-46P01743 117 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 LCKP06239 509 aa5.53□□□□□ -1.52
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HOXD8-202ENST00000429017 PGA4P0DJD7 388 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 PGA3P0DJD8 388 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 OR8G3PP0DMU2 310 aa5.53□□□□□ -1.52
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HOXD8-202ENST00000429017 UCP2P55851 309 aa5.53□□□□□ -1.52
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HOXD8-202ENST00000429017 LCN2P80188 198 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 SNCBQ16143 134 aa5.53□□□□□ -1.52
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HOXD8-202ENST00000429017 HIST3H3Q16695 136 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 DCAF12L2Q5VW00 463 aa5.53□□□□□ -1.52
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HOXD8-202ENST00000429017 TMEM154Q6P9G4 183 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
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HOXD8-202ENST00000429017 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF519Q8TB69 540 aa5.53□□□□□ -1.52
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HOXD8-202ENST00000429017 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 JMJD8Q96S16 334 aa5.53□□□□□ -1.52
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HOXD8-202ENST00000429017 MCHR1Q99705 422 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGDIGQ99819 225 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC28BQ9BUN5 200 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 LRMDAQ9H2I8 198 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM27Q9HBJ8 222 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 CDH20Q9HBT6 801 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 MMP26Q9NRE1 261 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF69Q9UC07 566 aa5.53□□□□□ -1.52
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HOXD8-202ENST00000429017 LOC100509620A0A075B734 347 aa5.52□□□□□ -1.53
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HOXD8-202ENST00000429017 B2RBV5 119 aa5.52□□□□□ -1.53
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HOXD8-202ENST00000429017 SLC22A2O15244 555 aa5.52□□□□□ -1.53
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HOXD8-202ENST00000429017 SNAP29O95721 258 aa5.52□□□□□ -1.53
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HOXD8-202ENST00000429017 DUSP7Q16829 419 aa5.52□□□□□ -1.53
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HOXD8-202ENST00000429017 DNAL1Q4LDG9 190 aa5.52□□□□□ -1.53
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HOXD8-202ENST00000429017 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.52□□□□□ -1.53
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HOXD8-202ENST00000429017 LRRC18Q8N456 261 aa5.52□□□□□ -1.53
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HOXD8-202ENST00000429017 OR1J1Q8NGS3 322 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 MCHR2Q969V1 340 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF566Q969W8 418 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 RAB39BQ96DA2 213 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SEPHS2Q99611 448 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 EBF4Q9BQW3 602 aa5.52□□□□□ -1.53
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