RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516658.1

RNU6-347P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 347, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-347P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-347P-201ENST00000516658 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 GJE1A6NN92 205 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 K7EQD1 137 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 DFFAO00273 331 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 GPR171O14626 319 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 GCGP01275 180 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 ARG1P05089 322 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 CT45A6P0DMU7 189 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 CT45A5P0DMU8 189 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 CT45A7P0DMV0 189 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 CDK4P11802 303 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 PAX1P15863 534 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 PRKACGP22612 351 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 ADORA2BP29275 332 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 GCKP35557 465 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 HMGCLP35914 325 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 PTGDSP41222 190 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 GDF5P43026 501 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 MAGEA3P43357 314 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 CSNK1DP48730 415 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 PROK1P58294 105 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 TAS2R39P59534 338 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 RHOAP61586 193 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 HMGCS1Q01581 520 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 TWIST1Q15672 202 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 KYAT1Q16773 422 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM249Q2WGJ8 235 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 C14orf28Q4W4Y0 310 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 CCNJQ5T5M9 372 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 FRMPD2BQ6IN97 320 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 WDR82Q6UXN9 313 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF627Q7L945 461 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 HORMAD1Q86X24 394 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 LFNGQ8NES3 379 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 OR2Y1Q8NGV0 311 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 SFXN5Q8TD22 340 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 CCDC28BQ9BUN5 200 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 CHIAQ9BZP6 476 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 MUTYHQ9UIF7 546 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 CLEC4EQ9ULY5 219 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 A0A087WW49 117 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 A0A1B0GVI7 797 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 E5RI56 91 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 G3V3Y1 287 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 SMKR1H3BMG3 65 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 M0QZ92 97 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 SSNA1O43805 119 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLC2A10O95528 541 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 ATP6V1G2O95670 118 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 TIMP1P01033 207 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 ORM1P02763 201 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 GP1BAP07359 652 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 TACSTD2P09758 323 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 OR8U9P0C7N5 309 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 HLA-GP17693 338 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 F8A1P23610 371 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 MAS1LP35410 378 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 GLP1RP43220 463 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 HSPA13P48723 471 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 RPS14P62263 151 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 RPL32P62910 135 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 PAFAH1B2P68402 229 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 C2orf54Q08AI8 447 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 RAB31Q13636 194 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 GGTLC2Q14390 218 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPA17Q15506 151 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 MICAQ29983 383 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 PIGGQ5H8A4 983 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAM45BPQ6NSW5 357 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM179Q6ZVK1 233 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 CA13Q8N1Q1 262 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 Q8N402 240 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF843Q8N446 348 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 OR10Z1Q8NGY1 313 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 OR8U1Q8NH10 309 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.7 ms