RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf98	E9PRG8	122 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	MS4A18	H0YCH9	400 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN34	H7C241	214 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMM23	O14925	209 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHM	P01871	453 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	BPGM	P07738	259 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	BID	P55957	195 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	UFM1	P61960	85 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	HSF2	Q03933	536 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC36A2	Q495M3	483 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf87	Q6PH81	154 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	SPIC	Q8N5J4	248 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	SCAI	Q8N9R8	606 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4F5	Q8NH21	305 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	NUF2	Q9BZD4	464 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf10	Q9HB07	376 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		9.14	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	VWF	P04275	2813 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR91	A4D1P6	747 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	SNAP29	O95721	258 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV1-46	P01743	117 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	ADORA3	P0DMS8	318 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF12	P17014	697 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	RAG2	P55895	527 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPK11	Q15759	364 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	ESCO2	Q56NI9	601 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	ULK3	Q6PHR2	472 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	PXK	Q7Z7A4	578 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	PARP8	Q8N3A8	854 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35B4	Q969S0	331 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF566	Q969W8	418 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX37	Q96LM6	180 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNJ15	Q99712	375 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	NANOG	Q9H9S0	305 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	GLTP	Q9NZD2	209 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	NPTN	Q9Y639	398 aa		9.13	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	DHH	O43323	396 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	ITM2A	O43736	263 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	TGDS	O95455	350 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-13	P01766	116 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINE1	P05121	402 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	THEM4	Q5T1C6	240 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	TEPP	Q6URK8	271 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	HIPK4	Q8NE63	616 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	BBS10	Q8TAM1	723 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		9.12	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRN3	E7EW58	273 aa		9.11	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		9.11	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	PLPP3	O14495	311 aa		9.11	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTA4	O15217	222 aa		9.11	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	TM9SF1	O15321	606 aa		9.11	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF13	O43567	381 aa		9.11	□□□□□ -0.95
SKAP2-209	ENST00000497511	FZD7	O75084	574 aa		9.11	□□□□□ -0.95

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