RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 ASH2LQ9UBL3 628 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN4-201ENST00000272638 HEATR5AQ86XA9 2040 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN4-201ENST00000272638 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 MASP2O00187 686 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 SCGB1D2O95969 90 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 CLDN17P56750 224 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 DCDP81605 110 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 GRK1Q15835 563 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 SLC35D3Q5M8T2 416 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 BPIFB2Q8N4F0 458 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 CHD9Q3L8U1 2897 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 A0A0B4J293 547 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 SIGLEC6O43699 453 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 ZFAND5O76080 213 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 KNG1P01042 644 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 ANKRD34CP0C6C1 535 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 OVCH1Q7RTY7 1134 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 COMMD7Q86VX2 200 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 OR4S1Q8NGB4 309 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 GON7Q9BXV9 100 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 PLEK2Q9NYT0 353 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 OR52A1Q9UKL2 312 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 SRPK3Q9UPE1 567 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 PI4KAP42356 2102 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 OR2AT4A6NND4 320 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 TP53I11O14683 189 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 MBTPS2O43462 519 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 GLI4P10075 376 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 C17orf67Q0P5P2 114 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 SLC36A2Q495M3 483 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 OR10K1Q8NGX5 313 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 SLC22A8Q8TCC7 542 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 CCDC107Q8WV48 283 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 MAFIPQ8WZ33 124 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 OR51B6Q9H340 312 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 SZT2Q5T011 3432 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 TNFRSF10AO00220 468 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 ARPC3O15145 178 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF208O43345 1280 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 RGS11O94810 467 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 SFTPBP07988 381 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 RAB40ALP0C0E4 278 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 PI3P19957 117 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 RFC3P40938 356 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 GAS1P54826 345 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 DCAF7P61962 342 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 RHOUQ7L0Q8 258 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 CCDC28AQ8IWP9 274 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 LSMEM1Q8N8F7 131 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 ZFAND1Q8TCF1 268 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 LAT2Q9GZY6 243 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 STEAP1Q9UHE8 339 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 KLF4O43474 513 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 LAMTOR5O43504 91 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF432O94892 652 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 C9orf40Q8IXQ3 194 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 OR10G3Q8NGC4 313 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 OR51A2Q8NGJ7 313 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 PGLYRP3Q96LB9 341 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 MARVELD1Q9BSK0 173 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 F5H0A9 414 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 CSTBP04080 98 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 AKAIN1P0CW23 69 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 GLB1P16278 677 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 ITGA3P26006 1051 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 FASLGP48023 281 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 ARHGDIBP52566 201 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 HSF1Q00613 529 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 FUT7Q11130 342 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 SLC17A1Q14916 467 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 CDONQ4KMG0 1287 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 OR14L1PQ8NHC6 308 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 OR51E1Q8TCB6 317 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 SMIM4Q8WVI0 70 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 DOCK7Q96N67 2140 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 POLEQ07864 2286 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1B0GW55 424 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 FRG2CA6NGY1 282 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 LILRA5A6NI73 299 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 CENPBD1B2RD01 187 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 GABARAPH6UMI1 98 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 GPR171O14626 319 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 PHYHO14832 338 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 GDF9O60383 454 aa11.32□□□□□ -0.6
UBXN4-201ENST00000272638 DUX4L2P0CJ85 424 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.5 ms