RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Stra6lQ9DBN1 621 aa20.54■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PpieQ9QZH3 301 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bmp10Q9R229 421 aa20.54■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Arhgap21Q6DFV3 1944 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm45711E0CXA2 391 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm5799E9Q2M1 201 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm9493F6SVV1 192 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn1r120K7N6J6 305 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PvalbP32848 110 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 RptnP97347 1118 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 NfkbidQ2TB02 327 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1286Q7TQY2 305 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Psmf1Q8BHL8 271 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Emc3Q99KI3 261 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mllt1Q9ERL0 547 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mrap2D3Z1Q2 207 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn2r34E9PVI0 852 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn2r37F8VQD3 802 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Msl3l2G3X992 371 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn2r45L7N2B5 852 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn2r29L7N2D4 852 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 P06336 421 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CdaP56389 146 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc2a6Q3UDF0 497 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Grm7Q68ED2 915 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 2610318N02RikQ80VT5 305 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam221aQ8C790 301 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kctd20Q8CDD8 419 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Aqp3Q8R2N1 292 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ripply3Q924S9 152 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rita1Q9D1H0 253 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lrrc51Q9DAK8 192 aa20.53■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr576A0A0G2JFH3 312 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam90a1aA2A4E2 429 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wscd2D4PHA7 571 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn2r41E9Q5C7 852 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn2r48E9Q5D8 855 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn2r40F6W043 852 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm11168J3QN50 228 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn2r36K7N741 852 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Agpat1O35083 285 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AdaP03958 352 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Defb41Q30KP6 65 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pdp1Q3UV70 538 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TefmQ5SSK3 364 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Epha6Q62413 1035 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf511Q6P0X2 227 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 B630019K06RikQ7TNS5 333 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pom121Q8K3Z9 1200 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 BanpQ8VBU8 548 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Duoxa1Q8VE49 341 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr47Q8VF18 321 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr578Q8VH17 313 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cela1Q91X79 266 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lap3Q9CPY7 519 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Commd4Q9CQ02 199 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AplfQ9D842 499 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nkx2-4Q9EQM3 354 aa20.52■□□□□ 0.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm3542K7N6U2 270 aa20.52■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ly6fP35460 134 aa20.52■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gcnt2P97402 401 aa20.52■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc30a10Q3UVU3 470 aa20.52■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nufip2Q5F2E7 692 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc35a1Q61420 336 aa20.52■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hyal3Q8VEI3 412 aa20.52■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr131Q8VGC8 314 aa20.52■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kiaa0141Q9DCV6 510 aa20.52■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mrpl39Q9JKF7 336 aa20.52■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pde7bQ9QXQ1 446 aa20.52■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc25a25A2ASZ8 469 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1205A2ATJ7 307 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr727A2RTN7 324 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm21797J3QNW5 180 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1221L7MU53 311 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Spi1P17433 272 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 GifP52787 417 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rgs16P97428 201 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mtcp1Q60945 107 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 N6amt1Q6SKR2 214 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lrrc75aQ7TSF4 339 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Scml4Q80VG1 408 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem127Q8BGP5 238 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 DpcdQ8BPA8 203 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hbq1aQ8BYM1 145 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Colec10Q8CF98 277 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rab43Q8CG50 210 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q8R3Y5 413 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr510Q8VEW6 314 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp810Q99K45 461 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Park7Q99LX0 189 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Arv1Q9D0U9 266 aa20.51■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm42517A0A1Y7VLQ2 374 aa20.5■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gpr155A2AWR3 868 aa20.5■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm10112D3YWP5 117 aa20.5■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn1r91E9PZR7 307 aa20.5■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr152G3X9L8 316 aa20.5■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn1r175K7N6T9 304 aa20.5■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 P01637 128 aa20.5■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 LcatP16301 438 aa20.5■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tnfrsf1bP25119 474 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.6 ms