RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 SCLT1Q96NL6 688 aa7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 PNMA2Q9UL42 364 aa7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 PLCG2P16885 1265 aa7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 APOBRQ0VD83 1088 aa7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC62Q6P9F0 684 aa7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 P3H4Q92791 437 aa7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MTHFSP49914 203 aa7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 DRC3Q9H069 523 aa7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CETN3O15182 167 aa7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.2□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 N4BP3O15049 544 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 NUP58Q9BVL2 599 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SLMAPQ14BN4 828 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 INF2Q27J81 1249 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SNX21Q969T3 373 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SMARCA4P51532 1647 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MCTP2Q6DN12 878 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 POLE3Q9NRF9 147 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGAP5Q13017 1502 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MACROD2A1Z1Q3 448 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF213O14771 459 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 NLRP5P59047 1200 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 FSIP1Q8NA03 581 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 NCOA7Q8NI08 942 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SYNCQ9H7C4 482 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 STX10O60499 249 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CAPN2P17655 700 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SLC8A3P57103 927 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MIS12Q9H081 205 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SEL1L2Q5TEA6 688 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 BICD1Q96G01 975 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ERO1AQ96HE7 468 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 DEUP1Q05D60 604 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.19□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 FOSBP53539 338 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CCT6BQ92526 530 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ZMYM3Q14202 1370 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1B0GVL5 298 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC96Q2M329 555 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 TMC6Q7Z403 805 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 TRIM47Q96LD4 638 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC160A6NGH7 325 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 GIPC1O14908 333 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 VPS52Q8N1B4 723 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ATP2A3Q93084 1043 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CABP5Q9NP86 173 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 UBL4BQ8N7F7 174 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MAP3K1Q13233 1512 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ATRIPQ8WXE1 791 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 NOX5Q96PH1 765 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ADCY5O95622 1261 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 IFT20Q8IY31 132 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 TBC1D31Q96DN5 1066 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 FAM169AQ9Y6X4 670 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.18□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ELP1O95163 1332 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 I3L4J1 428 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MCM6Q14566 821 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC42Q96M95 316 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SPC25Q9HBM1 224 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 PFDN6O15212 129 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 GPATCH11Q8N954 259 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms