RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 SEC24BO95487 1268 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 ST5P78524 1137 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF609O15014 1411 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCC12Q96J65 1359 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 CNBD1Q8NA66 436 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GUL7 405 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP2B3Q16720 1220 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 CHMLP26374 656 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 IL27Q8NEV9 243 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 RFX7Q2KHR2 1363 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 AK9Q5TCS8 1911 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 PDE8BO95263 885 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC5A1P13866 664 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 DBNDD2Q9BQY9 259 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 MSH5O43196 834 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 GYS1P13807 737 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 NFIXQ14938 502 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 LPIN2Q92539 896 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 HAUS7Q99871 368 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 FSD1Q9BTV5 496 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 BOLA2Q9H3K6 86 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 PROM2Q8N271 834 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 AKT1S1Q96B36 256 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 RAD50Q92878 1312 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 STK32BQ9NY57 414 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 TIMM10P62072 90 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 XAGE2Q96GT9 111 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD2Q9GZV1 360 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 SPEF2Q9C093 1822 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 SERPINB2P05120 415 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 TM4SF1P30408 202 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM5Q71RC9 77 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 USP26Q9BXU7 913 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 VGLL2Q8N8G2 317 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 PAG1Q9NWQ8 432 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-212ENST00000591041 SGSM2O43147 1006 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 KBTBD3Q8NAB2 608 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNJ4P48050 445 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 ANAPC15P60006 121 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE4AQ14139 1066 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF827Q17R98 1081 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 TMC4Q7Z404 712 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.962e-6■■□□□ 12.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 CHRNDQ07001 517 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 RABEP1Q15276 862 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 FGFR2P21802 821 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 CAVIN4Q5BKX8 364 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 HSCBQ8IWL3 235 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 UTRNP46939 3433 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 GRAPQ13588 217 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLIM4O00461 696 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB7AO95365 584 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC15A2Q16348 729 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-212ENST00000591041 HELLSQ9NRZ9 838 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 ARAP2Q8WZ64 1704 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 ADORA1P30542 326 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 PDE6BP35913 854 aa27.25■■□□□ 1.95
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