RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 BBOX1O75936 387 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 TGFB2P61812 414 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 TMC4Q7Z404 712 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 A0A1B0GUL6 1792 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 GPR108Q9NPR9 543 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 CACNA1SQ13698 1873 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 APBB1O00213 710 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 CNKSR1Q969H4 720 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 CHRNA5P30532 468 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 TFCP2Q12800 502 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 KCNA3P22001 575 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 SLX4Q8IY92 1834 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 PDE8BO95263 885 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 METTL24Q5JXM2 366 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 SP8Q8IXZ3 490 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 LNPKQ9C0E8 428 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 DPEP1P16444 411 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 CHRNDQ07001 517 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 TNNI3KQ59H18 835 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 A0A0G2JLW4 131 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 PDE4AP27815 886 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 TTLL6Q8N841 843 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-210ENST00000568388 FGFR2P21802 821 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 PIM2Q9P1W9 311 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF609O15014 1411 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 LTBP1Q14766 1721 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 UBE4AQ14139 1066 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 ATP2B3Q16720 1220 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 AACSQ86V21 672 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 LPIN2Q92539 896 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 PODXL2Q9NZ53 605 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 A0A1B0GUL7 405 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 GRIN3BO60391 1043 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 TAF5LO75529 589 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 XDHP47989 1333 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 TIMM10P62072 90 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 STAP2Q9UGK3 403 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 ATP2B4P23634 1241 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 GPSM2P81274 684 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 SLC5A1P13866 664 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-210ENST00000568388 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-210ENST00000568388 MX1P20591 662 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-210ENST00000568388 PDE1AP54750 535 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-210ENST00000568388 AOX1Q06278 1338 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-210ENST00000568388 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-210ENST00000568388 SKAP1Q86WV1 359 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-210ENST00000568388 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-210ENST00000568388 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-210ENST00000568388 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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