RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 ECE2O60344 883 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 UFL1O94874 794 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 DOK7Q18PE1 504 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 SHTN1A0MZ66 631 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 PSMD14O00487 310 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 TTLL11Q8NHH1 800 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 DNAAF4Q8WXU2 420 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 GREM2Q9H772 168 aa29.03■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 GGA1Q9UJY5 639 aa29.03■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 H7C1W4 665 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 GCKRQ14397 625 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 KCNQ5Q9NR82 932 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 RTL9Q8NET4 1388 aa29.01■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 TRAF5O00463 557 aa29.01■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 TRPM4Q8TD43 1214 aa29.01■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 XDHP47989 1333 aa29■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 MICALL2Q8IY33 904 aa29■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 VEGFBP49765 207 aa28.99■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 LINS1Q8NG48 757 aa28.99■■■□□ 2.23
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PPP4C-212ENST00000567828 A0A1B0GUL6 1792 aa28.98■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 F6X3S4 739 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 G3V3G9 751 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 H7C1D1 291 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 CASP7P55210 303 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 DPF2Q92785 391 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 RASSF10A6NK89 507 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF521Q96K83 1311 aa28.95■■■□□ 2.23
PPP4C-212ENST00000567828 DEFB115Q30KQ5 88 aa28.95■■■□□ 2.22
PPP4C-212ENST00000567828 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.95■■■□□ 2.22
PPP4C-212ENST00000567828 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
PPP4C-212ENST00000567828 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.95■■■□□ 2.22
PPP4C-212ENST00000567828 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-212ENST00000567828 ATP2B4P23634 1241 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-212ENST00000567828 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-212ENST00000567828 FAM161AQ3B820 660 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-212ENST00000567828 CST9Q5W186 159 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-212ENST00000567828 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-212ENST00000567828 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-212ENST00000567828 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
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PPP4C-212ENST00000567828 EGFRP00533 1210 aa28.92■■■□□ 2.22
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PPP4C-212ENST00000567828 MED23Q9ULK4 1368 aa28.89■■■□□ 2.22
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PPP4C-212ENST00000567828 CSF1RP07333 972 aa28.89■■■□□ 2.22
PPP4C-212ENST00000567828 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
PPP4C-212ENST00000567828 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
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PPP4C-212ENST00000567828 ZNF408Q9H9D4 720 aa28.87■■■□□ 2.21
PPP4C-212ENST00000567828 TLL2Q9Y6L7 1015 aa28.87■■■□□ 2.21
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF609O15014 1411 aa28.86■■■□□ 2.21
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PPP4C-212ENST00000567828 FOXO4P98177 505 aa28.85■■■□□ 2.21
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PPP4C-212ENST00000567828 GRM1Q13255 1194 aa28.84■■■□□ 2.21
PPP4C-212ENST00000567828 CYP4F22Q6NT55 531 aa28.84■■■□□ 2.21
PPP4C-212ENST00000567828 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.84■■■□□ 2.21
PPP4C-212ENST00000567828 DLK2Q6UY11 383 aa28.84■■■□□ 2.21
PPP4C-212ENST00000567828 PODNQ7Z5L7 613 aa28.84■■■□□ 2.21
PPP4C-212ENST00000567828 CAPNS2Q96L46 248 aa28.84■■■□□ 2.21
PPP4C-212ENST00000567828 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.83■■■□□ 2.21
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PPP4C-212ENST00000567828 USP17L4A6NCW7 530 aa28.82■■■□□ 2.2
PPP4C-212ENST00000567828 GRM8O00222 908 aa28.82■■■□□ 2.2
PPP4C-212ENST00000567828 USP17L1Q7RTZ2 530 aa28.82■■■□□ 2.2
PPP4C-212ENST00000567828 TXNRD3Q86VQ6 643 aa28.82■■■□□ 2.2
PPP4C-212ENST00000567828 AIDAQ96BJ3 306 aa28.82■■■□□ 2.2
PPP4C-212ENST00000567828 ANKRD2Q9GZV1 360 aa28.82■■■□□ 2.2
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF804BA4D1E1 1349 aa28.81■■■□□ 2.2
PPP4C-212ENST00000567828 KLRK1P26718 216 aa28.81■■■□□ 2.2
PPP4C-212ENST00000567828 CHRNDQ07001 517 aa28.81■■■□□ 2.2
PPP4C-212ENST00000567828 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.81■■■□□ 2.2
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