RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 SCNN1DP51172 638 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 CXCL9Q07325 125 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 XDHP47989 1333 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 EPHX2P34913 555 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 RIMBP2O15034 1052 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 UFL1O94874 794 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 EYA3Q99504 573 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 GGA1Q9UJY5 639 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 UTYO14607 1347 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 APLP1P51693 650 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-219ENST00000550655 RAD17O75943 681 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 CHADLQ6NUI6 762 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 LDHDQ86WU2 507 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 ECE2O60344 883 aa22.44■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 KAZALD1Q96I82 304 aa22.44■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 ATP2B4P23634 1241 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 EPS15P42566 896 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 DOK7Q18PE1 504 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 SUCLG2Q96I99 432 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 MED23Q9ULK4 1368 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 TNIP1Q15025 636 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.41■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 PSMD14O00487 310 aa22.4■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 HTRA3P83110 453 aa22.4■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.4■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.4■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CS-219ENST00000550655 ZNF609O15014 1411 aa22.39■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 CHRNDQ07001 517 aa22.38■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 USP44Q9H0E7 712 aa22.38■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.37■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 KIF16BQ96L93 1317 aa22.37■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 PASKQ96RG2 1323 aa22.37■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.37■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.37■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.37■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.37■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.37■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 SHTN1A0MZ66 631 aa22.36■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.36■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.36■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.35■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.35■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 KLRK1P26718 216 aa22.35■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.35■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 DPF2Q92785 391 aa22.35■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 G3V3G9 751 aa22.34■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.34■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 MICALL2Q8IY33 904 aa22.33■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.33■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.33■■□□□ 1.17
CS-219ENST00000550655 SNAP23O00161 211 aa22.32■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 TAF5LO75529 589 aa22.32■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.32■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.32■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 PODNQ7Z5L7 613 aa22.32■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 CNTROBQ8N137 903 aa22.32■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 BCAR3O75815 825 aa22.31■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 COA1Q9GZY4 146 aa22.3■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms