RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 VPS53Q5VIR6 699 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 GBP4Q96PP9 640 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 CUL4AQ13619 759 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 HSPA1LP34931 641 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
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PRDM4-205ENST00000550376 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 ATP2B3Q16720 1220 aa25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.14■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 A0A0G2JLW4 131 aa25.14■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 NUCB2P80303 420 aa25.14■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 MCTP1Q6DN14 999 aa25.14■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.14■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.14■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 ZAP70P43403 619 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 KCNB2Q92953 911 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.11■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 NECAB1Q8N987 351 aa25.11■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 CERKQ8TCT0 537 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
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PRDM4-205ENST00000550376 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 FBXO3Q9UK99 471 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 PDE8BO95263 885 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 M0R2C6 588 aa25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 MCAMP43121 646 aa25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 OSBP2Q969R2 916 aa25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 CYP21A2P08686 494 aa25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-205ENST00000550376 PHKA1P46020 1223 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 RNF20Q5VTR2 975 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 AFF2P51816 1311 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 ME3Q16798 604 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 WASHC4Q2M389 1173 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 ERFEQ4G0M1 354 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.07■■□□□ 1.6
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PRDM4-205ENST00000550376 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 GNPATO15228 680 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 PARP10Q53GL7 1025 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 ST3GAL1Q11201 340 aa25.04■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC102BQ68D86 513 aa25.04■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 STK3Q13188 491 aa25.03■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.03■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.03■■□□□ 1.6
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PRDM4-205ENST00000550376 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.03■■□□□ 1.6
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PRDM4-205ENST00000550376 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 PHF14O94880 888 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.01■■□□□ 1.6
PRDM4-205ENST00000550376 MYH3P11055 1940 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 NCLP19338 710 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 SEPT12Q8IYM1 358 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 NEK1Q96PY6 1258 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 RFX7Q2KHR2 1363 aa25■■□□□ 1.59
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