RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.25□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.25□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STRN4Q9NRL3 753 aa7.25□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADAMTS2O95450 1211 aa7.24□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WNT7BP56706 349 aa7.24□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.24□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WWC1Q8IX03 1113 aa7.24□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.24□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KDRP35968 1356 aa7.24□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM83GA6ND36 823 aa7.24□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP17L8P0C7I0 530 aa7.24□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.24□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BTG4Q9NY30 223 aa7.24□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPG7Q9UQ90 795 aa7.24□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WNT7AO00755 349 aa7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNAI1P63096 354 aa7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RASSF7Q02833 373 aa7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IL16Q14005 1332 aa7.23□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHA1P01876 353 aa7.22□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SKOR1P84550 965 aa7.22□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLFN5Q08AF3 891 aa7.22□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC01559Q495D7 138 aa7.22□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NGLY1Q96IV0 654 aa7.22□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.22□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ERBB4Q15303 1308 aa7.22□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HSPA1LP34931 641 aa7.21□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.21□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF511Q8NB15 262 aa7.21□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BAP1Q92560 729 aa7.21□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.21□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CRB1P82279 1406 aa7.21□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IL2RBP14784 551 aa7.21□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VEGFBP49765 207 aa7.21□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SH3BP2P78314 561 aa7.21□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.21□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF521Q96K83 1311 aa7.2□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAP3K5Q99683 1374 aa7.2□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEFQ10587 303 aa7.2□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.2□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.2□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C8orf37Q96NL8 207 aa7.2□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IFT57Q9NWB7 429 aa7.2□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP35Q9P2H5 1018 aa7.2□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CACNA1FO60840 1977 aa7.2□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NBPF14Q5TI25 921 aa7.19□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.19□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.19□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.19□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.19□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.19□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NCAPD2Q15021 1401 aa7.19□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NR6A1Q15406 480 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MCM10Q7L590 875 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UNC5CLQ8IV45 518 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HPS1Q92902 700 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WNK3Q9BYP7 1800 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NRAPQ86VF7 1730 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 J3QL48 77 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EXOC5O00471 708 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCTN1Q14203 1278 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP21Q9UK80 565 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.18□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms