RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532029.6

LRRK1-208, Transcript of leucine rich repeat kinase 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRK1, Length 1,241 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRK1-208	ENST00000532029	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	GPSM2	P81274	684 aa		27.76	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		27.76	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	PSMD1	Q99460	953 aa		27.76	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		27.76	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	XDH	P47989	1333 aa		27.75	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	ATP8B2	P98198	1209 aa		27.75	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		27.75	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		27.75	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	UTRN	P46939	3433 aa		27.74	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		27.73	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	LMNB1	P20700	586 aa		27.73	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	CEP85	Q6P2H3	762 aa		27.73	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		27.73	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	C6orf229	H3BNL8	230 aa		27.72	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	CHRND	Q07001	517 aa		27.72	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	GGA1	Q9UJY5	639 aa		27.72	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	EYA2	O00167	538 aa		27.71	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	UFL1	O94874	794 aa		27.71	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	SIL1	Q9H173	461 aa		27.71	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	COPRS	Q9NQ92	184 aa		27.71	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		27.7	■■■□□ 2.03
LRRK1-208	ENST00000532029	ATP2B4	P23634	1241 aa		27.7	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	LRRC24	Q50LG9	513 aa		27.7	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	RNF181	Q9P0P0	153 aa		27.7	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	FBXO3	Q9UK99	471 aa		27.7	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		27.7	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	KCNJ4	P48050	445 aa		27.69	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	POLA2	Q14181	598 aa		27.69	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		27.69	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		27.69	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	SSH3	Q8TE77	659 aa		27.69	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	EYA3	Q99504	573 aa		27.69	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	METTL24	Q5JXM2	366 aa		27.68	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	POLL	Q9UGP5	575 aa		27.68	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		27.68	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		27.68	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	PPIP5K2	O43314	1243 aa		27.67	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	HMMR	O75330	724 aa		27.67	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	CIAO1	O76071	339 aa		27.67	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	PRELP	P51888	382 aa		27.67	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	VPS33B	Q9H267	617 aa		27.67	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	LTBP1	Q14766	1721 aa		27.67	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	TAF5L	O75529	589 aa		27.66	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	WASHC4	Q2M389	1173 aa		27.66	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		27.66	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	27.65	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		27.65	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	AAMP	Q13685	434 aa		27.64	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	AOC3	Q16853	763 aa		27.64	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		27.64	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	JDP2	Q8WYK2	163 aa		27.64	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
LRRK1-208	ENST00000532029	RIMBP2	O15034	1052 aa		27.63	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		27.63	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		27.63	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	SBF1	O95248	1867 aa		27.63	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.62	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	CHD4	Q14839	1912 aa		27.61	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	PDE8B	O95263	885 aa		27.61	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	NIM1K	Q8IY84	436 aa		27.61	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029		A0A1B0GUL6	1792 aa		27.6	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		27.6	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029		G3V3G9	751 aa		27.6	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	UBE4A	Q14139	1066 aa		27.6	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		27.6	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		27.6	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	MED23	Q9ULK4	1368 aa		27.6	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		27.59	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	SNAP23	O00161	211 aa		27.58	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
LRRK1-208	ENST00000532029	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
LRRK1-208	ENST00000532029	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		27.57	■■■□□ 2
LRRK1-208	ENST00000532029	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		27.57	■■■□□ 2
LRRK1-208	ENST00000532029	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
LRRK1-208	ENST00000532029	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		27.56	■■■□□ 2
LRRK1-208	ENST00000532029	TFCP2	Q12800	502 aa		27.55	■■■□□ 2
LRRK1-208	ENST00000532029	DOK7	Q18PE1	504 aa		27.55	■■■□□ 2
LRRK1-208	ENST00000532029	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
LRRK1-208	ENST00000532029	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		27.55	■■■□□ 2
LRRK1-208	ENST00000532029	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		27.55	■■■□□ 2
LRRK1-208	ENST00000532029	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		27.55	■■■□□ 2
LRRK1-208	ENST00000532029	COL4A5	P29400	1685 aa		27.55	■■■□□ 2

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