RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.38■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.38■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 KLRG1Q96E93 195 aa18.38■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 VPS33BQ9H267 617 aa18.38■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.38■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC57Q2TAC2 916 aa18.37■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 SMC1BQ8NDV3 1235 aa18.37■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 MEIS3Q99687 375 aa18.37■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 GNAI3P08754 354 aa18.36■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 COL4A5P29400 1685 aa18.36■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 MPHOSPH8Q99549 860 aa18.36■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 MINPP1Q9UNW1 487 aa18.36■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 HDAC5Q9UQL6 1122 aa18.36■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1B0GUL6 1792 aa18.35■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 XDHP47989 1333 aa18.35■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 GLTPD2A6NH11 291 aa18.35■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 PPIP5K2O43314 1243 aa18.35■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 RLBP1P12271 317 aa18.35■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 LARGE2Q8N3Y3 721 aa18.35■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 TBC1D16Q8TBP0 767 aa18.35■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa18.35■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 POLLQ9UGP5 575 aa18.35■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 C6orf229H3BNL8 230 aa18.34■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.34■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 AOC3Q16853 763 aa18.34■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 JDP2Q8WYK2 163 aa18.34■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TSTA3-208ENST00000528920 MS4A1P11836 297 aa18.33■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 TAF7LQ5H9L4 462 aa18.33■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 JMYQ8N9B5 988 aa18.33■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 GGA1Q9UJY5 639 aa18.33■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 FZD9O00144 591 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 UFL1O94874 794 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 ATP2B4P23634 1241 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 NIM1KQ8IY84 436 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 EYA3Q99504 573 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 ANKRD2Q9GZV1 360 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 CHRNDQ07001 517 aa18.31■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 WASHC4Q2M389 1173 aa18.31■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.31■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 PANK1Q8TE04 598 aa18.31■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF541Q9H0D2 1346 aa18.3■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 PLIN1O60240 522 aa18.3■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 CNNM1Q9NRU3 951 aa18.3■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 RIMBP2O15034 1052 aa18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 GNAI2P04899 355 aa18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 EIF6P56537 245 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 ZNRF3Q9ULT6 936 aa18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 LEMD3Q9Y2U8 911 aa18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 DDNO94850 711 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa18.28■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 MTX1Q13505 466 aa18.27■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 KLHDC4Q8TBB5 520 aa18.27■□□□□ 0.52
TSTA3-208ENST00000528920 MED23Q9ULK4 1368 aa18.27■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF804BA4D1E1 1349 aa18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 POTECB2RU33 542 aa18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 TAF5LO75529 589 aa18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 PDE3AQ14432 1141 aa18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 GPC2Q8N158 579 aa18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 DBNDD1Q9H9R9 158 aa18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 SCN9AQ15858 1988 aa18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 SCN4AP35499 1836 aa18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 MROH5Q6ZUA9 1318 aa18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 YDJCA8MPS7 323 aa18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 KCNJ4P48050 445 aa18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 MVPQ14764 893 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 DOK7Q18PE1 504 aa18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 LRRC24Q50LG9 513 aa18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 PSME4Q14997 1843 aa18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 EYA2O00167 538 aa18.24■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 SRGAP3O43295 1099 aa18.24■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 ECE2O60344 883 aa18.24■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 CXCL9Q07325 125 aa18.24■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 FBXO3Q9UK99 471 aa18.24■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 COG6Q9Y2V7 657 aa18.24■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 G3V3G9 751 aa18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 SNAP23O00161 211 aa18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 DCAF8Q5TAQ9 597 aa18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 CIAPIN1Q6FI81 312 aa18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-208ENST00000528920 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms