RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1W2PP55 124 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP3K10Q02779 954 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NLRP13Q86W25 1043 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MEIOBQ8N635 442 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 J3QL48 77 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANAPC15P60006 121 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TYRO3Q06418 890 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ENPP3O14638 875 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KLF4O43474 513 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SOX9P48436 509 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VEGFBP49765 207 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB33AQ14088 237 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF697Q5TEC3 545 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPRYD7Q5W111 196 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNTG2Q9NY99 539 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBP1Q9NZI7 540 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TLR6Q9Y2C9 796 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1W2PNR3 127 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPINT1O43278 529 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PF4P02776 101 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RLBP1P12271 317 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EDN3P14138 238 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MSX1P28360 303 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RHOVQ96L33 236 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IFT57Q9NWB7 429 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HCSTQ9UBK5 93 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SASH3O75995 380 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EGFRP00533 1210 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RHOQP17081 205 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHMP4BP1P59074 171 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RASA3Q14644 834 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SV2BQ7L1I2 683 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHC3Q8NDX5 983 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ABCB6Q9NP58 842 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CELA3AP09093 270 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GARTP22102 1010 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LIG3P49916 1009 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APOBRQ0VD83 1088 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NKD1Q969G9 470 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BRD7Q9NPI1 651 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1B0GTH6 734 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GREM1O60565 184 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAJC6O75061 913 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UPP2O95045 317 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms