RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 LBX1P52954 281 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC27Q2M243 656 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 TSPYL6Q8N831 410 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 GGA1Q9UJY5 639 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 UFL1O94874 794 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 TRPM4Q8TD43 1214 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP2K2P36507 400 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 SAPCD2Q86UD0 394 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 USP48Q86UV5 1035 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 WWC1Q8IX03 1113 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 SHTN1A0MZ66 631 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC4A2P04920 1241 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC184Q52MB2 194 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 HHIPL1Q96JK4 782 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 PCNTO95613 3336 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 XDHP47989 1333 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 ANP32CO43423 234 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP2B4P23634 1241 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 MRS2Q9HD23 443 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 IL16Q14005 1332 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 CTSWP56202 376 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 IGKV5-2P06315 115 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 RTL9Q8NET4 1388 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 AOC2O75106 756 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 PODNQ7Z5L7 613 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 SULF1Q8IWU6 871 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 HUNKP57058 714 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 COL4A1P02462 1669 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 CA12O43570 354 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 G2E3Q7L622 706 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 H7C1W4 665 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 EGFRP00533 1210 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 FLIIQ13045 1269 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 GREM2Q9H772 168 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L3A6NCW0 530 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L4A6NCW7 530 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 NOGQ13253 232 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR63Q8IWG1 891 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L8P0C7I0 530 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 ADM5C9JUS6 153 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 GCKRQ14397 625 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 RGMBQ6NW40 437 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 DLK2Q6UY11 383 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC102AQ96A19 550 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 GGA3Q9NZ52 723 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 SCARF1Q14162 830 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 LINS1Q8NG48 757 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 OGFOD1Q8N543 542 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXW7Q969H0 707 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 TSKSQ9UJT2 592 aa24.56■■□□□ 1.52
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