RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491937.5

RPS7-209, Transcript of ribosomal protein S7, human

TSL 2

Gene RPS7, Length 987 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS7-209	ENST00000491937	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	33.98	■■■■□ 3.03
RPS7-209	ENST00000491937	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	33.97	■■■■□ 3.03
RPS7-209	ENST00000491937	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		33.97	■■■■□ 3.03
RPS7-209	ENST00000491937	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		33.97	■■■■□ 3.03
RPS7-209	ENST00000491937	PDE8A	O60658	829 aa		33.96	■■■■□ 3.03
RPS7-209	ENST00000491937	MAP2K2	P36507	400 aa		33.96	■■■■□ 3.03
RPS7-209	ENST00000491937	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		33.96	■■■■□ 3.03
RPS7-209	ENST00000491937	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		33.96	■■■■□ 3.03
RPS7-209	ENST00000491937	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	33.96	■■■■□ 3.03
RPS7-209	ENST00000491937	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	33.96	■■■■□ 3.03
RPS7-209	ENST00000491937	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		33.95	■■■■□ 3.03
RPS7-209	ENST00000491937	RTL9	Q8NET4	1388 aa		33.95	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937	AOC2	O75106	756 aa		33.94	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		33.94	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937	UFL1	O94874	794 aa		33.93	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	33.93	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937	USP48	Q86UV5	1035 aa		33.93	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	33.92	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937	GGA1	Q9UJY5	639 aa		33.92	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		33.92	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937		G3V3G9	751 aa		33.91	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		33.91	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937	TSPYL6	Q8N831	410 aa		33.91	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	33.91	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937	EGFR	P00533	1210 aa		33.9	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		33.89	■■■■□ 3.02
RPS7-209	ENST00000491937	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	33.88	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	KSR2	Q6VAB6	950 aa		33.88	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		33.88	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	33.88	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	SCN9A	Q15858	1988 aa		33.88	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	STK31	Q9BXU1	1019 aa		33.87	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		33.86	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		33.86	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	XDH	P47989	1333 aa		33.85	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	CA12	O43570	354 aa		33.85	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	HUNK	P57058	714 aa		33.85	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		33.85	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	DLK2	Q6UY11	383 aa		33.85	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	IGKV5-2	P06315	115 aa		33.84	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	33.84	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	CTSW	P56202	376 aa		33.84	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		33.84	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	CCDC27	Q2M243	656 aa		33.84	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	TSKS	Q9UJT2	592 aa		33.84	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	ABHD8	Q96I13	439 aa		33.83	■■■■□ 3.01
RPS7-209	ENST00000491937	ADM5	C9JUS6	153 aa		33.82	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	NOG	Q13253	232 aa		33.82	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	CCDC184	Q52MB2	194 aa		33.82	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	ATP2B4	P23634	1241 aa		33.81	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	WWC1	Q8IX03	1113 aa		33.81	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	ZNF609	O15014	1411 aa		33.8	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	33.8	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	33.8	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	33.8	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		33.8	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	GGA3	Q9NZ52	723 aa		33.8	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	SULF1	Q8IWU6	871 aa		33.79	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		33.79	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		33.79	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		33.77	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	MYH3	P11055	1940 aa		33.77	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	PSME4	Q14997	1843 aa		33.76	■■■■□ 3
RPS7-209	ENST00000491937	PODN	Q7Z5L7	613 aa		33.76	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	GREM2	Q9H772	168 aa		33.76	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	33.76	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	IL16	Q14005	1332 aa		33.76	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	SLC4A2	P04920	1241 aa		33.75	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	RGMB	Q6NW40	437 aa		33.75	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	G2E3	Q7L622	706 aa		33.75	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	USP17L3	A6NCW0	530 aa		33.74	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	USP17L4	A6NCW7	530 aa		33.74	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		33.74	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	ZIC5	Q96T25	663 aa		33.74	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		33.74	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	MED23	Q9ULK4	1368 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	USP17L8	P0C7I0	530 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	GML	Q99445	158 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	SCARF1	Q14162	830 aa		33.72	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937		H7C1W4	665 aa		33.71	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	33.71	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	CCDC102A	Q96A19	550 aa		33.71	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	SPEF2	Q9C093	1822 aa		33.71	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	CDCA5	Q96FF9	252 aa		33.7	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		33.7	■■■□□ 2.99
RPS7-209	ENST00000491937	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
RPS7-209	ENST00000491937	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
RPS7-209	ENST00000491937	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
RPS7-209	ENST00000491937	FLII	Q13045	1269 aa		33.69	■■■□□ 2.98
RPS7-209	ENST00000491937	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	33.68	■■■□□ 2.98

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.6 ms