RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488576.5

FAM107B-222, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-222	ENST00000488576	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		5.13	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		5.13	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		5.13	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	MUC3B	Q9H195	1237 aa		5.13	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	PPME1	Q9Y570	386 aa		5.13	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	HMX2	A2RU54	273 aa		5.12	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	MMP20	O60882	483 aa		5.12	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	DPYD	Q12882	1025 aa		5.12	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	UVSSA	Q2YD98	709 aa		5.12	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		5.12	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		5.12	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		5.12	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	LINC01387	J3KSC0	135 aa		5.11	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	SOX18	P35713	384 aa		5.11	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		5.11	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	MYO19	Q96H55	970 aa		5.11	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	JAG1	P78504	1218 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	MYRFL	Q96LU7	910 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	FOXO3	O43524	673 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	PTK7	Q13308	1070 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	TREML1	Q86YW5	311 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FAM107B-222	ENST00000488576	TM4SF5	O14894	197 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	USP17L15	C9J2P7	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	USP17L10	C9JJH3	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	USP17L12	C9JPN9	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	USP17L11	C9JVI0	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	USP17L21	D6R901	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	USP17L18	D6R9N7	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	USP17L22	D6RA61	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	USP17L19	D6RCP7	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	USP17L20	D6RJB6	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	CDC27	P30260	824 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	WEE1	P30291	646 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	CDC25B	P30305	580 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	ATP11A	P98196	1134 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	USP17L24	Q0WX57	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	CEP135	Q66GS9	1140 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	OGFOD2	Q6N063	350 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	BEND4	Q6ZU67	534 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	NLRP13	Q86W25	1043 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	ABI1	Q8IZP0	508 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	FSCN2	O14926	492 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	BMP3	P12645	472 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM196B	A6NMK8	535 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	WDR64	B1ANS9	1081 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	ADAM11	O75078	769 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	PREP	P48147	710 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	HYAL2	Q12891	473 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	OR13H1	Q8NG92	308 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	SPACA7	Q96KW9	195 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	C8A	P07357	584 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	EPHA1	P21709	976 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	COX20	Q5RI15	118 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	GLMN	Q92990	594 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	ARX	Q96QS3	562 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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