RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRD-211ENST00000486161 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRD-211ENST00000486161 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRD-211ENST00000486161 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRD-211ENST00000486161 HLA-DOAP06340 250 aa9.78□□□□□ -0.84
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PTPRD-211ENST00000486161 COPRSQ9NQ92 184 aa9.78□□□□□ -0.84
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PTPRD-211ENST00000486161 RIMBP2O15034 1052 aa9.78□□□□□ -0.84
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PTPRD-211ENST00000486161 SERPINB2P05120 415 aa9.78□□□□□ -0.84
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PTPRD-211ENST00000486161 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.78□□□□□ -0.84
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PTPRD-211ENST00000486161 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.78□□□□□ -0.84
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PTPRD-211ENST00000486161 RAD50Q92878 1312 aa9.77□□□□□ -0.85
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PTPRD-211ENST00000486161 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
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PTPRD-211ENST00000486161 ERFEQ4G0M1 354 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
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PTPRD-211ENST00000486161 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRD-211ENST00000486161 BBOX1O75936 387 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 NBPF15Q8N660 670 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 KRT23Q9C075 422 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 CABP5Q9NP86 173 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 GPR108Q9NPR9 543 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 PDE8BO95263 885 aa9.74□□□□□ -0.85
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