RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
PRAME-212ENST00000485532 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.28■□□□□ 0.2
PRAME-212ENST00000485532 ZNF408Q9H9D4 720 aa16.28■□□□□ 0.2
PRAME-212ENST00000485532 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
PRAME-212ENST00000485532 PGAP2Q9UHJ9 254 aa16.28■□□□□ 0.2
PRAME-212ENST00000485532 TLL2Q9Y6L7 1015 aa16.28■□□□□ 0.2
PRAME-212ENST00000485532 SPEF2Q9C093 1822 aa16.28■□□□□ 0.2
PRAME-212ENST00000485532 PI4KAP2A4QPH2 592 aa16.27■□□□□ 0.2
PRAME-212ENST00000485532 PDE8AO60658 829 aa16.27■□□□□ 0.2
PRAME-212ENST00000485532 AOC2O75106 756 aa16.27■□□□□ 0.2
PRAME-212ENST00000485532 IGKV5-2P06315 115 aa16.27■□□□□ 0.2
PRAME-212ENST00000485532 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
PRAME-212ENST00000485532 G2E3Q7L622 706 aa16.27■□□□□ 0.2
PRAME-212ENST00000485532 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa16.27■□□□□ 0.2
PRAME-212ENST00000485532 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 H7C1D1 291 aa16.26■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 UFL1O94874 794 aa16.26■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 DDX58O95786 925 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 CCDC152Q4G0S7 254 aa16.26■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 WWC1Q8IX03 1113 aa16.26■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.26■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 KSR2Q6VAB6 950 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 USP48Q86UV5 1035 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 DPF2Q92785 391 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 EYA3Q99504 573 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 PODXL2Q9NZ53 605 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 MYH3P11055 1940 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 CDC37L1Q7L3B6 337 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 GGA1Q9UJY5 639 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 ECE1P42892 770 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 CTSWP56202 376 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 CCDC27Q2M243 656 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 STK31Q9BXU1 1019 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 TSKSQ9UJT2 592 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 CCER2I3L3R5 266 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 SLC4A2P04920 1241 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 VIL1P09327 827 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 TTLL11Q8NHH1 800 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 GREM2Q9H772 168 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 MRS2Q9HD23 443 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 PSME4Q14997 1843 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 NEURL1BA8MQ27 555 aa16.21■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 ADM5C9JUS6 153 aa16.21■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 G3V3G9 751 aa16.21■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 RPS12P25398 132 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.21■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 KRT26Q7Z3Y9 468 aa16.21■□□□□ 0.19
PRAME-212ENST00000485532 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa16.2■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 ZIC5Q96T25 663 aa16.2■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 XDHP47989 1333 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 H7C1W4 665 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 NEXNQ0ZGT2 675 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 CHMP4AQ9BY43 222 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 MINPP1Q9UNW1 487 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 IL16Q14005 1332 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 MAP2K2P36507 400 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 FLIIQ13045 1269 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 GGA3Q9NZ52 723 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 ATP2B4P23634 1241 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 HUNKP57058 714 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 HHIPL1Q96JK4 782 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 BEGAINQ9BUH8 593 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 MXD3Q9BW11 206 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 CASP7P55210 303 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 GCKRQ14397 625 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 TXNRD3Q86VQ6 643 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 GMLQ99445 158 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 VAMP4O75379 141 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 CCT4P50991 539 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 SCARF1Q14162 830 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 FAM161AQ3B820 660 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 CACNA1FO60840 1977 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-212ENST00000485532 USP17L3A6NCW0 530 aa16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms