RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468310.5

PRKCZ-208, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 5

Gene PRKCZ, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-208	ENST00000468310	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		27.56	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		27.56	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310		H7C1D1	291 aa		27.55	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	CTSW	P56202	376 aa		27.55	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	WDR63	Q8IWG1	891 aa		27.55	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	MICALL2	Q8IY33	904 aa		27.55	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		27.55	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	GGA1	Q9UJY5	639 aa		27.55	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		27.54	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	SPEF2	Q9C093	1822 aa		27.54	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	CACNA1F	O60840	1977 aa		27.53	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	SHTN1	A0MZ66	631 aa		27.53	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	FLII	Q13045	1269 aa		27.53	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	TNS4	Q8IZW8	715 aa		27.53	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		27.53	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	AIDA	Q96BJ3	306 aa		27.53	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		27.52	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	DPF2	Q92785	391 aa		27.52	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		27.52	■■■□□ 2
PRKCZ-208	ENST00000468310	CST9	Q5W186	159 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	XDH	P47989	1333 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	RTL9	Q8NET4	1388 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	FOXN1	O15353	648 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	VAMP4	O75379	141 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	GREM2	Q9H772	168 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	SCN9A	Q15858	1988 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310		H7C1W4	665 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	GRM1	Q13255	1194 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	GCKR	Q14397	625 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	ATP2B4	P23634	1241 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
PRKCZ-208	ENST00000468310	ECE1	P42892	770 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	CAPNS2	Q96L46	248 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	27.45	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	LINS1	Q8NG48	757 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	WBP1L	Q9NX94	342 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	27.43	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	27.43	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	USP48	Q86UV5	1035 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	27.43	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	PSME4	Q14997	1843 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	EGFR	P00533	1210 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	27.42	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	CAPN15	O75808	1086 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	27.4	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	27.4	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	27.4	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	ITGA6	P23229	1130 aa		27.39	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	CASP7	P55210	303 aa		27.39	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	FAM161A	Q3B820	660 aa		27.39	■■□□□ 1.98
PRKCZ-208	ENST00000468310	MED23	Q9ULK4	1368 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	27.38	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310		F6X3S4	739 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	27.38	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	PODN	Q7Z5L7	613 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	USP17L3	A6NCW0	530 aa		27.37	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	USP17L4	A6NCW7	530 aa		27.37	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		27.37	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	LBX1	P52954	281 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	DLK2	Q6UY11	383 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF609	O15014	1411 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	ADM5	C9JUS6	153 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	AOC2	O75106	756 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	CSF1R	P07333	972 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PRKCZ-208	ENST00000468310	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		27.35	■■□□□ 1.97

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