RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446903.5

TNS1-210, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS1, Length 2,464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-210ENST00000446903 SUSD4Q5VX71 490 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 CPA1P15085 419 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 CASTP20810 708 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 AK2P54819 239 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 AKAP2Q9Y2D5 859 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 GOLIM4O00461 696 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 KLHL40Q2TBA0 621 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 RUFY3Q7L099 469 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 TICAM2Q86XR7 235 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 XAGE2Q96GT9 111 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 SH3TC1Q8TE82 1336 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 LAMB2P55268 1798 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 PTF1AQ7RTS3 328 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.58■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 AK7Q96M32 723 aa16.58■□□□□ 0.25
TNS1-210ENST00000446903 GAS2L3Q86XJ1 694 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 USP21Q9UK80 565 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 TAF6LQ9Y6J9 622 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 BTAF1O14981 1849 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 NHSQ6T4R5 1651 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 KCNJ4P48050 445 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 TSGA10IPQ3SY00 556 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 VPS53Q5VIR6 699 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 AKAP11Q9UKA4 1901 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 SLFNL1Q499Z3 407 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 PARP10Q53GL7 1025 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 METTL24Q5JXM2 366 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 NTSR2O95665 410 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 ATP2B3Q16720 1220 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 MCTP1Q6DN14 999 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 ABCC12Q96J65 1359 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 SCARF1Q14162 830 aa16.55■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.55■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.55■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 HELLSQ9NRZ9 838 aa16.55■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 PDRG1Q9NUG6 133 aa16.55■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 HMG20BQ9P0W2 317 aa16.55■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.55■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.54■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 LARGE1O95461 756 aa16.54■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 RNF20Q5VTR2 975 aa16.54■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.54■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 SCN7AQ01118 1682 aa16.54■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 BRD1O95696 1058 aa16.54■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 KCNQ4P56696 695 aa16.54■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 MYH7P12883 1935 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 FAM177BA6PVY3 158 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 PDE8BO95263 885 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 GORABQ5T7V8 394 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 LMBRD1Q9NUN5 540 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 RTL9Q8NET4 1388 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 MAST3O60307 1309 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 PSMA5P28066 241 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 CERKQ8TCT0 537 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-210ENST00000446903 SBF2Q86WG5 1849 aa16.52■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 ST3GAL1Q11201 340 aa16.52■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 CLEC4GQ6UXB4 293 aa16.52■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 COL4A1P02462 1669 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 CASZ1Q86V15 1759 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 FGFR2P21802 821 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 RPS6KB1P23443 525 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 ZAP70P43403 619 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 PI16Q6UXB8 463 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 SEC31BQ9NQW1 1179 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 CYP21A2P08686 494 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 MCAMP43121 646 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 DSCC1Q9BVC3 393 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-210ENST00000446903 LY75O60449 1722 aa16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.5 ms