RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 ABHD8Q96I13 439 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 PLA2G12BQ9BX93 195 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF6P56537 245 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 KIAA2012Q0VF49 1180 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 GPC2Q8N158 579 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 SSH1Q8WYL5 1049 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-205ENST00000444916 SPEF2Q9C093 1822 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 GPSM2P81274 684 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 ALDH1L2Q3SY69 923 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 GREM2Q9H772 168 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 PTPRCP08575 1304 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 ALDH1L1O75891 902 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM161AQ3B820 660 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC4A10Q6U841 1118 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 GJA3Q9Y6H8 435 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 BCL2L13Q9BXK5 485 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 PODXL2Q9NZ53 605 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNRF3Q9ULT6 936 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 GRM8O00222 908 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC34A2O95436 690 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 CSF1RP07333 972 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 WASHC4Q2M389 1173 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 SMC4Q9NTJ3 1288 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 POLLQ9UGP5 575 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 C6orf229H3BNL8 230 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 TRAF5O00463 557 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 EPS15P42566 896 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 GRM1Q13255 1194 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 TBC1D16Q8TBP0 767 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 EYA3Q99504 573 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 UFL1O94874 794 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 ITGA6P23229 1130 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 SCNN1DP51172 638 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.464e-6■■□□□ 11.5
SH3BP4-205ENST00000444916 CYP4F22Q6NT55 531 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 GGA1Q9UJY5 639 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 XDHP47989 1333 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 FOXO4P98177 505 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 CXCL9Q07325 125 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 CAPNS2Q96L46 248 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 TSKSQ9UJT2 592 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 THSD7BQ9C0I4 1608 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 CST9Q5W186 159 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC85CA6NKD9 419 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 YDJCA8MPS7 323 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 RIMBP2O15034 1052 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 TNIP1Q15025 636 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 CIAPIN1Q6FI81 312 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 DBNDD1Q9H9R9 158 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 MINPP1Q9UNW1 487 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 UTYO14607 1347 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 AOC2O75106 756 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 RAD17O75943 681 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP2B4P23634 1241 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 EPHA10Q5JZY3 1008 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 LMBR1LQ6UX01 489 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 MPHOSPH8Q99549 860 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 CHMP3Q9Y3E7 222 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 ECE2O60344 883 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 RARSP54136 660 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 SCN9AQ15858 1988 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1B0GUL6 1792 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 DOK7Q18PE1 504 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 SUCLG2Q96I99 432 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 GPRC5DQ9NZD1 345 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 TRPM7Q96QT4 1865 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 PSME4Q14997 1843 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 MED23Q9ULK4 1368 aa17.83■□□□□ 0.45
SH3BP4-205ENST00000444916 KIF16BQ96L93 1317 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-205ENST00000444916 ECE1P42892 770 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-205ENST00000444916 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-205ENST00000444916 CCT4P50991 539 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC57Q2TAC2 916 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-205ENST00000444916 KAZALD1Q96I82 304 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD2Q9GZV1 360 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-205ENST00000444916 TLL2Q9Y6L7 1015 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-205ENST00000444916 ZBED9Q6R2W3 1325 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4-205ENST00000444916 G3V3G9 751 aa17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.7 ms