RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439372.5

ATP6AP1-204, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, human

TSL 4

Gene ATP6AP1, Length 604 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP1-204	ENST00000439372	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		28.81	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		28.81	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		28.81	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		28.81	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		28.81	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LMNB1	P20700	586 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RNF181	Q9P0P0	153 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	COL4A5	P29400	1685 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	AAMP	Q13685	434 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	POLL	Q9UGP5	575 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MTX1	Q13505	466 aa		28.76	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		28.76	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	XDH	P47989	1333 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CHRND	Q07001	517 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SRGAP3	O43295	1099 aa		28.74	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LRRC24	Q50LG9	513 aa		28.74	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		28.74	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		28.73	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	UFL1	O94874	794 aa		28.73	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ATP8B2	P98198	1209 aa		28.73	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	AOC3	Q16853	763 aa		28.73	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		28.73	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GGA1	Q9UJY5	639 aa		28.73	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	C6orf229	H3BNL8	230 aa		28.72	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		28.72	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PPIP5K2	O43314	1243 aa		28.71	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NEFL	P07196	543 aa		28.71	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CEP85	Q6P2H3	762 aa		28.71	■■■□□ 2.19
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TAF5L	O75529	589 aa		28.7	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ATP2B4	P23634	1241 aa		28.7	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	YY1	P25490	414 aa		28.7	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		28.7	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SNAP23	O00161	211 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SIL1	Q9H173	461 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EYA2	O00167	538 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RIMBP2	O15034	1052 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HMMR	O75330	724 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	COPRS	Q9NQ92	184 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	POLA2	Q14181	598 aa		28.67	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	WASHC4	Q2M389	1173 aa		28.67	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		28.67	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SSH3	Q8TE77	659 aa		28.67	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	VPS33B	Q9H267	617 aa		28.67	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EYA3	Q99504	573 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	METTL24	Q5JXM2	366 aa		28.65	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		28.65	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KLRK1	P26718	216 aa		28.64	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FBXO3	Q9UK99	471 aa		28.64	■■■□□ 2.18
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CIAO1	O76071	339 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KCNJ4	P48050	445 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NIM1K	Q8IY84	436 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	JDP2	Q8WYK2	163 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MED23	Q9ULK4	1368 aa		28.62	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DOK7	Q18PE1	504 aa		28.62	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		28.62	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SCN9A	Q15858	1988 aa		28.62	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		28.62	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		28.62	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FZD9	O00144	591 aa		28.61	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		28.61	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		28.61	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		28.61	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	28.6	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	YDJC	A8MPS7	323 aa		28.59	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PDE8B	O95263	885 aa		28.59	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	UBE4A	Q14139	1066 aa		28.58	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		28.58	■■■□□ 2.17
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PSME4	Q14997	1843 aa		28.57	■■■□□ 2.16
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ECE2	O60344	883 aa		28.57	■■■□□ 2.16
ATP6AP1-204	ENST00000439372	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16

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