RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432502.1

NUP50-AS1-202, humanhuman

TSL 2

Gene NUP50-AS1, Length 596 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-202ENST00000432502 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 SLC4A2P04920 1241 aa25.05■■□□□ 1.6
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 MICALL2Q8IY33 904 aa25.05■■□□□ 1.6
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.03■■□□□ 1.6
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.01■■□□□ 1.59
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.01■■□□□ 1.59
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.97■■□□□ 1.59
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.96■■□□□ 1.59
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 LINS1Q8NG48 757 aa24.94■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 LBX1P52954 281 aa24.93■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PODNQ7Z5L7 613 aa24.93■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.93■■□□□ 1.58
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CSF1RP07333 972 aa24.92■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.92■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.92■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GMLQ99445 158 aa24.92■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.92■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 AOC2O75106 756 aa24.9■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CAPN15O75808 1086 aa24.9■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GRM1Q13255 1194 aa24.9■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DLK2Q6UY11 383 aa24.9■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 USP17L3A6NCW0 530 aa24.89■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 USP17L4A6NCW7 530 aa24.89■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ITGA6P23229 1130 aa24.89■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.89■■□□□ 1.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FAM161AQ3B820 660 aa24.88■■□□□ 1.57
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.88■■□□□ 1.57
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BEND3Q5T5X7 828 aa24.87■■□□□ 1.57
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