RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.09■■□□□ 1.77
C4orf48-201ENST00000409248 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.09■■□□□ 1.77
C4orf48-201ENST00000409248 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.09■■□□□ 1.77
C4orf48-201ENST00000409248 XDHP47989 1333 aa26.09■■□□□ 1.77
C4orf48-201ENST00000409248 C6orf229H3BNL8 230 aa26.08■■□□□ 1.77
C4orf48-201ENST00000409248 FZD9O00144 591 aa26.08■■□□□ 1.77
C4orf48-201ENST00000409248 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.08■■□□□ 1.77
C4orf48-201ENST00000409248 USP44Q9H0E7 712 aa26.08■■□□□ 1.77
C4orf48-201ENST00000409248 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.07■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 GGA1Q9UJY5 639 aa26.07■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.07■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 UFL1O94874 794 aa26.06■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.06■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.06■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 KIF3CO14782 793 aa26.05■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 PDE3AQ14432 1141 aa26.05■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 WASHC4Q2M389 1173 aa26.05■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.05■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.05■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 POLLQ9UGP5 575 aa26.05■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 RLBP1P12271 317 aa26.04■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 PANK1Q8TE04 598 aa26.04■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 KAZALD1Q96I82 304 aa26.04■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.04■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 A0A1B0GUL6 1792 aa26.03■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 ATP2B4P23634 1241 aa26.03■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 RRAGCQ9HB90 399 aa26.03■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.03■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 SCN4AP35499 1836 aa26.02■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.02■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 GPC2Q8N158 579 aa26.02■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.02■■□□□ 1.76
C4orf48-201ENST00000409248 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.01■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 IQCA1LA6NCM1 817 aa26■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 GNAI3P08754 354 aa25.99■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.99■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 MED23Q9ULK4 1368 aa25.98■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 RIMBP2O15034 1052 aa25.98■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.98■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.98■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.98■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 G3V3G9 751 aa25.97■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 TOMM70O94826 608 aa25.97■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 C1QTNF8P60827 252 aa25.97■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 CHRNDQ07001 517 aa25.97■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.97■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 MEIS3Q99687 375 aa25.97■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 COG6Q9Y2V7 657 aa25.97■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.97■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 KCNJ4P48050 445 aa25.96■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.96■■□□□ 1.75
C4orf48-201ENST00000409248 ECE2O60344 883 aa25.95■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 TNIP1Q15025 636 aa25.95■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.95■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.95■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.94■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 CXCL9Q07325 125 aa25.94■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 YDJCA8MPS7 323 aa25.93■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 POTECB2RU33 542 aa25.93■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 HACL1Q9UJ83 578 aa25.93■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 PSME4Q14997 1843 aa25.93■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 RAD17O75943 681 aa25.92■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 DOK7Q18PE1 504 aa25.92■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.9■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 SCN9AQ15858 1988 aa25.9■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
C4orf48-201ENST00000409248 TAF5LO75529 589 aa25.88■■□□□ 1.73
C4orf48-201ENST00000409248 GNAI2P04899 355 aa25.88■■□□□ 1.73
C4orf48-201ENST00000409248 EPHX2P34913 555 aa25.88■■□□□ 1.73
C4orf48-201ENST00000409248 SCNN1DP51172 638 aa25.88■■□□□ 1.73
C4orf48-201ENST00000409248 PODNQ7Z5L7 613 aa25.88■■□□□ 1.73
C4orf48-201ENST00000409248 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.88■■□□□ 1.73
C4orf48-201ENST00000409248 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
C4orf48-201ENST00000409248 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
C4orf48-201ENST00000409248 FSTL1Q12841 308 aa25.87■■□□□ 1.73
C4orf48-201ENST00000409248 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
C4orf48-201ENST00000409248 CRBNQ96SW2 442 aa25.87■■□□□ 1.73
C4orf48-201ENST00000409248 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
C4orf48-201ENST00000409248 COA1Q9GZY4 146 aa25.87■■□□□ 1.73
C4orf48-201ENST00000409248 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms