RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 TUBB4AP04350 444 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 HOXB7P09629 217 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 IQCA1Q86XH1 822 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 KIAA0754O94854 1291 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 PALD1Q9ULE6 856 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 PRC1O43663 620 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 YEATS4O95619 227 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 ZBTB43O43298 467 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 GPTP24298 496 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 MCM3P25205 808 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 SPA17Q15506 151 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 ATL3Q6DD88 541 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 FAM227BQ96M60 508 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 CHST3Q7LGC8 479 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 IP6K1Q92551 441 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 UNC13BO14795 1591 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 CBX8Q9HC52 389 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 FEZ1Q99689 392 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 IFNKQ9P0W0 207 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 NLRP5P59047 1200 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 RGS12O14924 1447 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 ERLIN2O94905 339 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF75DP51815 510 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 BRAPQ7Z569 592 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-202ENST00000373779 SSH3Q8TE77 659 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 OGFRQ9NZT2 677 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 ATP2B3Q16720 1220 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 TET3O43151 1660 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 ATP2B2Q01814 1243 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 HELLSQ9NRZ9 838 aa20■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 CHAMP1Q96JM3 812 aa20■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 USP44Q9H0E7 712 aa20■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 WTAPQ15007 396 aa20■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 KRT23Q9C075 422 aa20■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 CENPHQ9H3R5 247 aa20■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 DTNBO60941 627 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 SYT10Q6XYQ8 523 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 A0A1B0GVL5 298 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 TNNI3KQ59H18 835 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 TAF4BQ92750 862 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 CLTCL1P53675 1640 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 CHRNA2Q15822 529 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 ARFGAP3Q9NP61 516 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF853P0CG23 659 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 CNNM2Q9H8M5 875 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 ME3Q16798 604 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 TRERF1Q96PN7 1200 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRU-202ENST00000373779 N4BP3O15049 544 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms