RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367760.7

PRRX1-202, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 2,217 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-202ENST00000367760 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 NECAB1Q8N987 351 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 A0A1B0GUL7 405 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 GOLIM4O00461 696 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 LRRC24Q50LG9 513 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 BTG4Q9NY30 223 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 TIMM10P62072 90 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 ZMYND15Q9H091 742 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 ABCC12Q96J65 1359 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 TCHHQ07283 1943 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 CSF1RP07333 972 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 ITGB4P16144 1822 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 CYP21A2P08686 494 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 BCL9O00512 1426 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 GTF3C6Q969F1 213 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 FIBPO43427 364 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 KRT85P78386 507 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 GORABQ5T7V8 394 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 ELP1O95163 1332 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 Q6ZUG5 572 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 UVSSAQ2YD98 709 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 FAM89AQ96GI7 184 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 EXOC5O00471 708 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 NLRP10Q86W26 655 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 XAGE2Q96GT9 111 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 MAST3O60307 1309 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-202ENST00000367760 CHGBP05060 677 aa20.08■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 FGD1P98174 961 aa20.08■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.08■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.08■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 TERF1P54274 439 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 KIF3AQ9Y496 699 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 PFKFB2O60825 505 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 OFD1O75665 1012 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 STK3Q13188 491 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 CTSWP56202 376 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 BRF1Q92994 677 aa20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 ATP2B3Q16720 1220 aa20.04■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 METTL24Q5JXM2 366 aa20.04■□□□□ 0.8
PRRX1-202ENST00000367760 FBXL16Q8N461 479 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms