RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365174.1

RNA5SP223-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 223, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP223, Length 120 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP223-201ENST00000365174 NYXQ9GZU5 481 aa6.32□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.32□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.32□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 STAP2Q9UGK3 403 aa6.32□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 BTAF1O14981 1849 aa6.32□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 KCNQ2O43526 872 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 ST18O60284 1047 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 CIAO1O76071 339 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 SEC24BO95487 1268 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 BRD1O95696 1058 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 RFC4P35249 363 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 ITPK1Q13572 414 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 HLFQ16534 295 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 CCDC152Q4G0S7 254 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 TNNI3KQ59H18 835 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 CCDC158Q5M9N0 1113 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 TTC39AQ5SRH9 613 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 EVI5LQ96CN4 794 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 PPME1Q9Y570 386 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 AK9Q5TCS8 1911 aa6.31□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 UNCXA6NJT0 531 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 EYA2O00167 538 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 PHF14O94880 888 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 ITGA6P23229 1130 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 EIF5P55010 431 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 FOXO4P98177 505 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 TFCP2Q12800 502 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 RABEP1Q15276 862 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 FAM182BQ5T319 152 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 TMTC2Q8N394 836 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 KAZALD1Q96I82 304 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 SETDB2Q96T68 719 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 BCORQ6W2J9 1755 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 ZNF609O15014 1411 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 SCN7AQ01118 1682 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 RREB1Q92766 1687 aa6.3□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 RAD50Q92878 1312 aa6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 CAMTA2O94983 1202 aa6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 SLC5A1P13866 664 aa6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 ERCC3P19447 782 aa6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 CASP7P55210 303 aa6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 ATP2B3Q16720 1220 aa6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 GPR108Q9NPR9 543 aa6.29□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 UBN2Q6ZU65 1347 aa6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 NUP98P52948 1817 aa6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 RPS6KA4O75676 772 aa6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 SASH1O94885 1247 aa6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 CHMLP26374 656 aa6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 RXRBP28702 533 aa6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 ST5P78524 1137 aa6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 RNF20Q5VTR2 975 aa6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 GREM2Q9H772 168 aa6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RNA5SP223-201ENST00000365174 NARFQ9UHQ1 456 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89 ms