RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 GPR108Q9NPR9 543 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 GPATCH3Q96I76 525 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF609O15014 1411 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 GRAPQ13588 217 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 STAP2Q9UGK3 403 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 TTC22Q5TAA0 569 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 A0A1B0GUL7 405 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 H0YIN7 160 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 PDE8BO95263 885 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 A0A1B0GUL6 1792 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 SRGNP10124 158 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 TIMM10P62072 90 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 CHRNDQ07001 517 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 ATP2B3Q16720 1220 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 ECHDC1Q9NTX5 307 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 AOX1Q06278 1338 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 NPR1P16066 1061 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 TAF5LO75529 589 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 MASTLQ96GX5 879 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 CHRNA5P30532 468 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 KLHL34Q8N239 644 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 ERC2O15083 957 aa26.76■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 PTGER2P43116 358 aa26.76■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.76■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.76■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 SPON1Q9HCB6 807 aa26.76■■□□□ 1.88
HOXA4-201ENST00000360046 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 ALDH1B1P30837 517 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 GORABQ5T7V8 394 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 BBOX1O75936 387 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 XAGE2Q96GT9 111 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 CACNA1SQ13698 1873 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 ADORA1P30542 326 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 LPIN2Q92539 896 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 SLC5A1P13866 664 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 STYK1Q6J9G0 422 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 SNAP23O00161 211 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 FGFR2P21802 821 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 A0A0G2JLW4 131 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 SDSP20132 328 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXA4-201ENST00000360046 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 AK9Q5TCS8 1911 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 DPEP1P16444 411 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 KCNJ4P48050 445 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 C8orf34Q49A92 452 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 SLC51AQ86UW1 340 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 ATP5JP18859 108 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 TTC39AQ5SRH9 613 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 TMC4Q7Z404 712 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 CNKSR1Q969H4 720 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 RILPL2Q969X0 211 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 BOLA2Q9H3K6 86 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 TGFB2P61812 414 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 UBE4AQ14139 1066 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 XDHP47989 1333 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 SP8Q8IXZ3 490 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 CNTROBQ8N137 903 aa26.65■■□□□ 1.86
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