RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 SASH1O94885 1247 aa23.65■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 Q6ZUG5 572 aa23.65■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 TAF5LO75529 589 aa23.65■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 CLCN6P51797 869 aa23.65■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.64■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
PPP1CC-201ENST00000335007 TULP2O00295 520 aa23.64■■□□□ 1.37
PPP1CC-201ENST00000335007 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.63■■□□□ 1.37
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PPP1CC-201ENST00000335007 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.63■■□□□ 1.37
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PPP1CC-201ENST00000335007 SCRN1Q12765 414 aa23.62■■□□□ 1.37
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PPP1CC-201ENST00000335007 CCP110O43303 1012 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-201ENST00000335007 ANXA1P04083 346 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.62■■□□□ 1.37
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PPP1CC-201ENST00000335007 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.371e-13■■■■□ 25.2
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PPP1CC-201ENST00000335007 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-201ENST00000335007 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-201ENST00000335007 SMC2O95347 1197 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-201ENST00000335007 ME1P48163 572 aa23.6■■□□□ 1.37
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PPP1CC-201ENST00000335007 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-201ENST00000335007 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-201ENST00000335007 NCAPD2Q15021 1401 aa23.6■■□□□ 1.37
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PPP1CC-201ENST00000335007 USP54Q70EL1 1684 aa23.58■■□□□ 1.36
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PPP1CC-201ENST00000335007 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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PPP1CC-201ENST00000335007 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PPP1CC-201ENST00000335007 HOMER1Q86YM7 354 aa23.57■■□□□ 1.36
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PPP1CC-201ENST00000335007 ATP8B1O43520 1251 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP1CC-201ENST00000335007 TPM1P09493 284 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP1CC-201ENST00000335007 FOSBP53539 338 aa23.56■■□□□ 1.36
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PPP1CC-201ENST00000335007 MNS1Q8NEH6 495 aa23.55■■□□□ 1.36
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PPP1CC-201ENST00000335007 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PPP1CC-201ENST00000335007 LGR6Q9HBX8 967 aa23.55■■□□□ 1.36
PPP1CC-201ENST00000335007 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.55■■□□□ 1.36
PPP1CC-201ENST00000335007 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.55■■□□□ 1.36
PPP1CC-201ENST00000335007 BTBD11A6QL63 1104 aa23.54■■□□□ 1.36
PPP1CC-201ENST00000335007 CYP21A2P08686 494 aa23.54■■□□□ 1.36
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PPP1CC-201ENST00000335007 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.54■■□□□ 1.36
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